Op-perl PERL-modules voor OBO-geformatteerde ontologieën
Download nu

Op-perl Rangschikking & Samenvatting

Op-perl Tags

Perl-module perl ontologieën

Op-perl Beschrijving

Op-Perl Een verzameling Perl-modules voor het omgaan met obo-geformatteerde ontologieën (zoals de genontologie). Deze codeverdeling verzamelt objectgeoriënteerde modules (om ontaltelementen zoals een term, een relatie, een synoniem enzovoort), scripts (voor typische taken zoals indelingsconversies: OBO2OWL, OWL2OBO; er zijn ook veel voorbeelden Dat kan eenvoudig worden aangepast voor specifieke toepassingen), en een uitgebreide set testbestanden om de implementatiekwaliteit te waarborgen. Citing to-Perl: als u op-Perl in uw werk gebruikt, wordt u vriendelijk verzocht om te citeren: op-Perl: API ondersteunt de ontwikkeling en analyse van bio-ontologieën E. Antezana; M. Egana; B. DE BAETS; M. KUIPER; V. Mironov Bioinformatics 2008; DOI: 10.1093 / Bioinformatics / BTN042SEE Ook: 1. PERLDOC op-Perl.Pod 2. Op-Toolkit: een set van Galaxy-tools om te gaan met Obo-geformatteerde ontologieën, Antezana E, Venkatesan A, Mungall C, Mironov V, Kuiper M . BMC BIOINFORMATICS 2010, 11 (MEVEE 12): S8 DOI: 10.1186 / 1471-2105-11-S12-S8FILES IN OP-PERL: README README-bestand Installeren Hoe u op-PERL (Vereisten) Installeert PERL-XYTAR.GZ Op-Perl API: Versie XY (GZIP-bestand) Wijzigingen Beschrijving Over de wijzigingen in Perlemark: op-Perl wordt "AS-IS" verschaft. De huidige versie is stabiel; Niettemin worden verbeteringen verwacht, evenals feedback is zeer welkom. Ga naar constant deze repository voor het controleren van up-to-date versies van deze distribution.Product's startpagina

Op-perl Gerelateerde software