Open babel Een cross-platform chemieprogramma en -bibliotheek die is ontworpen om bestandsindelingen te converteren
Download nu

Open babel Rangschikking & Samenvatting

Open babel Tags

bibliotheek Scheikunde Chemie-programma Chemie-bibliotheek moleculaire modellering interconverteren

Open babel Beschrijving

Een cross-platform chemieprogramma en -bibliotheek ontworpen om bestandsindelingen te converteren Open Babel-project is ontworpen om op te halen waar Babel is gebleven, als een grootformaatprogramma en de bibliotheek die is ontworpen om te interconverteren tussen vele bestandsindelingen die worden gebruikt in moleculaire modellering en computationele chemie. Hier zijn enkele belangrijke functies van "Open Babel": · Een enorme verscheidenheid aan gemeenschappelijke indelingen voor het chemisch bestanden, waaronder SDF / Mol, Mol2, PDB, Smiles, XYZ, CML ... (Details) · Erkenning van bestandstype op basis van bestandsnaamextensie · Chemical Mime-ondersteuning · Smarts-matcher · Flexibele Atom Typer · Flexibele bondtyper voor perceptie van meerdere obligaties van atomaire coördinaten · GADIGER PARTIALE LADINGSBEROKING · Hydrogen-toevoeging en deletie · Isotoop-ondersteuning, berekening van gemiddelde en exacte massa's · Automatische functie-perceptie (ringen, obligaties, hybridisatie, aromaticiteit) · Multiple Conformer-opslag binnen moleculen · Opdrachtregelconversie voor meerdere moleculen in één bestand · Opdrachtregelinterface · Bitvector-klasse · Vector- en matrix-transformaties · Moleculaire testsuite · Open-source / Free-software onder de GNU General Public License · Kruisplatform (Windows, Linux, Mac OS X, SGI, Solaris, Dreamcast ...) Wat is er nieuw in deze release: · Deze release vertegenwoordigt een grote bugfix-release en is een stabiele upgrade, sterk aanbevolen voor alle gebruikers van Open Babel. Hoewel er misschien niet veel nieuwe functies zijn, zijn vele crashes en andere bugs opgelost sinds 2.2.1. · Gepercialiseerd naar de nieuwe Inchi 1.02-release om gestandaardiseerde Inchi- en Inchikey-uitgang te produceren. · Veel fouten van vele stereochemische fouten bij het lezen / schrijven van glimlachen. Dit maakt deel uit van een groter project dat is voltooid in de 2.3-release. · Vaste compilatie en installatie op de platforms van Cygwin en Mingw. · Beperkte aanwijzing van aromaticiteit en kekule-obligaties. · Verbeterde 2D -> 3D-coördinaatgeneratie · Verbeterde coördinaatgeneratie met behulp van de opdrachtregeloperatie --gen3D · Verbeterde prestaties voor het genereren van coördinaten. · NIEUWE - FILLUC-opdrachtregeloperatie voor Babel. · Fixes to pH-afhankelijke waterstof toevoeging. · Ondersteuning toegevoegd voor het lezen van vibratiegegevens van Molden, Molpro- en NWCHEM-uitvoerbestanden. · Bijgewerkte atomaire radii van recente theoretische berekeningen. · Vaste bug bij het lezen van GZIP-gecomprimeerde MOM2- of XML-bestanden. · Sluit bestanden na een fout. Fixeert een bug met PyBel waar bestanden open blijven. Veel meer bugfixes en kleine functieverbeteringen. == Nieuwe bestandsindelingen == Import en export: · MIMPRO INPUT EN OUTPUT. · VAP-coördinatenbestanden (Contcar en POSCAR).

Open babel Gerelateerde software