| Pybpn Identificeer significante verbindingen tussen biologische processen met behulp van gen Interaction Networks |
Download nu |
Pybpn Rangschikking & Samenvatting
- Vergunning:
- MIT/X Consortium Lic...
- Naam uitgever:
- Christopher D. Lasher
Pybpn Tags
Pybpn Beschrijving
Pybpn is een Python-module die programma's biedt om verbindingen te detecteren tussen biologische processen (genaamd "Links") op basis van gen-interactie, expressie en annotatiegegevens. Een verzameling van significante links en de deelnemende processen vormt een biologisch procesnetwerk of BPN.PYBPN biedt drie gerelateerde programma's voor het vinden van BPN's, elk met verschillende doelstellingen: BPLN bepaalt of processen in het algemeen zijn aangesloten; een implementatie van het algoritme beschreven door Dotan-Cohen et al. .cbpn bepaalt of, onder een bepaalde vergelijking van omstandigheden, verbindingen tussen processen is verstoord; een implementatie van het algoritme beschreven door Lasher et al. .MCMCBPN vergelijkbaar met CBPN, maar probeert de kleinste reeks verbindingen te ontdekken die zoveel mogelijk van de verstoring van de interactie-genen beschrijft. PRODUCTION's startpagina
Pybpn Gerelateerde software