Seedwatersegmenter Een grafisch Python-programma voor interactief segment beeldstapels cellen in weefsel met edge-labels
Download nu

Seedwatersegmenter Rangschikking & Samenvatting

Seedwatersegmenter Tags

afbeelding segment stapels

Seedwatersegmenter Beschrijving

Seedwatersegmenter is een grafisch python-tool aan interactief segment beeldstapels cellen in weefsel met edge-labels (aka. Witte contouren). De interacties zijn volledig gebaseerd op het bewerken van zaden, die op hun beurt worden uitgebreid door een stroomgebiedalgoritme. Het grootste verschil tussen SWS en andere gereedschappen is dat je meer dan één zaad per cel kunt plaatsen die je kan helpen de grenzen van moeilijke cels aan te passen. Ws is gebouwd op de top van Wxpython, Matplotlib, Numpy, Scipy en Mahotas.at zijn kern , het gebruikt een bliksemsnel waterig algoritme (dankzij het MAHOTAS-project) en maakt real-time updates mogelijk. Het heeft een eenvoudige (als rommelige) UI en is volledig interactief, zelfs inclusief undo-level. De publicatie over SW's die al deze details en meer geeft in cytometrie deel A: http: //onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002 /cyto.a.22034/abstractOource-code wordt weerspiegeld naar vier repositories en naar PYPI: - GitHub: http://github.com/davidmashburn/seedwatersegmenter/- bitbucket: http://bitbucket.org/davidmashburn/Seedwatersegmenter- Gitorious: http://gitorious.org/seedwatersegmenter- Google-code: http://code.google.com/p/seedwater/- PYPI: http://pypi.pypthon.org/pypi/seedwatersegmentthe Google CODE-pagina heeft ook een binair Releases (http://code.google.com/p/seedwater/) die moeten werken aan 32-bits Windows of 64-bit Linux, maar deze zijn nu oud. Gebruik nu de "easy_install" -methode. Voor meer informatie, zie Python Installatie-instructies 20xx.txt Mogelijk wilt u ook de handleiding lezen: Seedwater Segmenter V xx-handleiding.txtinstalling en runninginstalling is eindelijk eenvoudig! In feite kunt u nu "easy_install Seedwatersegmenter "Snelle instructies: Windows / Mac: Installeer Enthance Python Distribution http://www.denting.com/products/edudownload.phpubuntu/debian: Sudo Apt-Get Install Python-Setuptools Python-WXTools Python-Numy Python-Scipy Python- MATPLOTLIB Python-Imaging Python-XLRD PYTHON-XLWTIN Een CMD-venster (moet worden uitgevoerd als beheerder onder Windows Vista / 7) of Terminal (Mac / Linux), Uitvoeren: Easy_Install MAHOTAS CMPGEN ELLIPSEFITER FILENAMESORT GiftiffLoader ImageContour SeedwatersegmenterDetailed Instructies: De nieuwste versie wordt genoemd: "Python Installeer instructies augustus 2012.txt" https://github.com/davidmashburn/seedwatersegmenter/blob/master/python Installatie-instructies Augustus 2012.TxtProduct's Homepage

Seedwatersegmenter Gerelateerde software