Taverna Een gedistribueerde compulencomponenten in Java
Download nu

Taverna Rangschikking & Samenvatting

Taverna Tags

gedistribueerd berekenen Workflow-componenten Bereken workflow Taverna

Taverna Beschrijving

Een gedistribueerd berekenen workflowcomponenten Java Taverna is een verzameling van workflow enactment en beschrijving componenten, waaronder een hogere programmeertaal voor workflows genoemd Scufl (Simple Conceptuele Unified Flow Language), een pure Java-object model, parser om het model te bevolken, en een set van standpunten en controllers (waaronder enkele Swing componenten te laten vallen in uw workflow-enabled applicaties). Om in feite lopen workflows moet u ook de myGrid workflow enactment engine.Taverna kerngegevens modellen zijn voorzien van het voorwerp voorstellingen van de workflow zelf, alle entiteiten van de workflow (processors, havens, dataverbindingen etc) en het model voor de data waarden stromende langs dataverbindingen tijdens een workflow enactment.Taverna taak uitbreidingen zitten in een enactment motor - in dit geval FreeFluo - en concrete implementaties van de abstracte taken die door Processor objecten binnen de workflow object model. Het zijn deze taken die de logica die nodig is om contact te web services, lopen lokale Java-klassen en het uitvoeren van de andere acties in verband met hun Processor entities.Instances van de taak extensies worden gemaakt wanneer een werkstroom en bijbehorende ingang voorwerpen door de Workflow Submission Interface worden ingediend . Deze interface kan een proces in java methodeaanroep of kan worden aangevoerd over bepaalde voertuigen zoals SOAP bij een remote service gebaseerd bekrachtiging de motor. FreeFluo kan optreden in beide modi, de Taverna werkbank een instantie van de FreeFluo enactor omvat fundamentele wet diensten aan gebruikers zonder centrale workflow engine server.The grafische gebruikersinterface klassen zitten op een clientcomputer en laat interactie met de kerngegevens model klassen en als met het runnen van workflow-objecten binnen een enactment motor. Dit maakt workflow constructie, bewerken en visualisatie alsook enactor en dataservices surfen over de resultaten en tussentijdse waarden binnen een workflow instance.The opslaginterface wordt een inplugbare raamwerk waarmee externe gegevens en metagegevens opgeslagen gebeurtenissen nemen binnen de workflow service en vaststelling verzameling informatie over deze gebeurtenissen. Dit kan onder meer een herkomst verzameling plugin die de workflow enactment en registreert metadata in RDF vorm waakt erover, of een opslag plugin welke stromen resultaten terug te gaan naar een relatie database, eventueel een Life Science Identifier (LSID) autoriteit, zoals de vaststelling runs.The LSID instantie interface is een alleen-lezen toegang tot data opgeslagen in een datageheugen, en kan eventueel worden gebruikt door de Taverna grafische gebruikerinterface componenten resultaten van eerdere werkstromen en gebruik maken van deze als invoer voor opeenvolgende ophalen. Vereisten: · Java 2 Standaard Edition Runtime-omgeving Wat is er nieuw in deze release: Beestje: · - ophalen resultaat onvoorspelbaar · - SVG renderer werkt niet · - tabblad Default "Metadata" voor de input / output-poorten verwarrend · - Het niet workflows gaat om resultaten te legen · - Column 'ding' te kort in het logboek van database schema · - T2 Enactment Fout met Pauls workflow · - T2 invoerdialoog niet opent na een fout · - Workflow scavenger dropping havens en script inhoud voor Rshell · - Vermijd Raven / Maven afhankelijkheid voor execution service op afstand · - Remote execution service gebruik van verouderde Taverna profiel · - TestJavaProcess mislukt tijdens Maven build · - T2 Valdation mislukt processors bevatten samengevoegde poorten. · - T2 FileDataManager en FileBlobStore gebruikt File.mkdirs niet thread-safe · - goViz er niet is · - documentatie is verouderd · - JTidyWorkerTest mislukt vanwege tekenset veronderstellingen Verbetering: · - De uitvoering versie van de workflow moet hetzelfde zijn als de bewerking versie. · - Geneste workflow locatie · - Disconnected uitgangen mislukt workflow · - Mac OS X plist verbeteringen bestand · - Toevoegen Onbekende host Exception in PluginManager Nieuwe functie: · - Embedded browser binnen taverna · - serialiseren boon tot in plaats streamen van het bestand · - T2 Renderers verfijning: · - Verbeterde workflow editor toe te voegen verbeterde drag and drop mogelijkheden Taak: · - hiermee kunnen meerdere implementaties van de Monitor-interface

Taverna Gerelateerde software