 | UgeneGeïntegreerde bio-informatica-tools |
| Download nu | |
Ugene Rangschikking & Samenvatting
Advertentie
Ugene Tags
Ugene Beschrijving
Geïntegreerde Bioinformatics Gereedschap UGENE is een gratis cross-platform genoomanalyse suite.It werkt perfect op Linux, Windows of Mac OS en vereist slechts een paar muisklikken te installeren. Hier zijn een aantal belangrijke eigenschappen van "UGENE": Belangrijkste kenmerken: · Meervoudige sequentiepositionering behulp MUSCLE SPIER 3 en 4; · HMM profielen op te bouwen en te zoeken, op basis van de bron van HMMER 2 en HMMER 3; · PCR Primers gebruikend Primer 3; · Eiwit secundaire structuurvoorspelling behulp GOR IV en PSIPRED; · Zoeken naar restrictie-enzymen en de integratie met rebase; · Extreem snelle herhalen vinder; · Zoeken naar transcriptiefactor bindingsplaatsen gebruik SITECON; · ORF vinder; · Compleet Smith-Waterman-algoritme implementatie. Gebruikersomgeving: · Visuele en interactieve genoom browsing; · Chromatogrammen visualisatie; · 3D-viewer voor bestanden in VOB en MMDB formaten; · Meervoudige sequentiepositionering editor; · Makkelijk te workflow designer gebruiken voor aangepaste computational workflows. · High Performance Computing in UGENE · Volledige ondersteuning van de moderne multicore processoren en SSE-instructies; · Out of the box ondersteuning van de moderne GPU's met behulp van NVIDIA CUDA en ATI Stroom; · Geïntegreerde oplossingen voor de Cell Broadband Engine; · Private oplossingen voor supercomputers en distributed computing. Medewerking: · Kan gebruikt worden voor het onderwijs in scholen en universiteiten; · Functies die moeten worden opgenomen in de volgende versie worden geïnitieerd door de gebruikers; · UGENE team staat klaar om samen te werken in projecten gerelateerd, zowel gratis of commerciële. Vereisten: · Qt Wat is er nieuw in deze release: Nieuwe plug-ins: · MUSCLE 4 - een poort van de nieuwste gereedschap voor meerdere sequenties van Robert C. Edgar; · CUDA ondersteuning - een hulpprogramma plugin die het mogelijk maakt het gebruik van NVIDIA grafische verwerkingseenheden voor het versnellen van algoritmes. Nieuwe functies en bugfixes: · CUDA-versnelde Smith-Waterman-algoritme is klaar om te gebruiken voor Windows-gebruikers; · Één van de meest verwachte kenmerken: sequentie bewerking is toegevoegd; · Exporteren annotatie tabellen naar CSV is voorzien; · HMM2 modellen ondersteuning is toegevoegd aan HMM3; · En vele anderen. Zie de changelog voor een volledige lijst van verbeteringen.
Ugene Gerelateerde software
