Annoteersequentie met GFF

Annoteer een sequentie met annotaties van een GFF-bestand.
Download nu

Annoteersequentie met GFF Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • CLC bio
  • Uitgever website:
  • http://www.clcbio.com
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X 10.0 or later
  • Bestandsgrootte:
  • 373 KB

Annoteersequentie met GFF Tags


Annoteersequentie met GFF Beschrijving

Annotate-reeks met GFF is een plug-in waarmee u een sequentie met annotaties van een GFF-bestand (generieke functie-indeling) in CLC Workbench of CLC-server kunt annoteren. Een GFF-bestand bevat geen sequentie-informatie, het bevat slechts een lijst met annotaties. U kunt meer lezen over het formaat op http://www.sanger.ac.uk/software/formats/gff. U kunt ook GTF-bestanden gebruiken (genoverdrachtsindeling). Dit formaat wordt gebruikt door onder meer de UCSC-genoombrowser op http://genome.ucsc.edu. Als u een annotatietrack (bijvoorbeeld SNPS, REPERSS) downloadt, kunt u dit als een GTF-bestand krijgen. GTF-bestanden die zijn gedownload van de UCSC-genoombrowser zijn niet compatibel met de RNA-SEQ-analyse van CLC Genomics Workbench, omdat de gen- en transcriptannotaties niet kunnen worden gematigd.Note: de annotaatsequentie met GFF-software is alleen voor onderzoeksdoeleinden.


Annoteersequentie met GFF Gerelateerde software