Biococoa

Open source, Objective-C Framework voor het parseren en schrijven van sequence-bestandsindelingen
Download nu

Biococoa Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • BioCocoa Team
  • Uitgever website:
  • http://www.bioinformatics.org/biococoa/
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X
  • Bestandsgrootte:
  • 803 KB

Biococoa Tags


Biococoa Beschrijving

Open Source, Objective-C Framework voor het parseren en schrijven van sequence-bestandsindelingen Biococoa is een open source en objectief-C-cacaopader voor bioinformatica. Cacao is een geweldig kader voor snelle applicatie-ontwikkeling en wordt daarom vaak gebruikt om innovatieve biowetenschappelijke apps te maken. Om de ontwikkeling nog meer te versnellen, wil BioCocoa herbruikbare cacao-klassen aanbieden die specifiek zijn voor moleculaire biologie en biofinformatica. Op dit moment biedt Biococoa modelklassen voor biologische sequenties, controllerclasses voor uitlijning, reeks manipulatie en I / O, interfacing met entrez en bekijk klassen waarmee u eenvoudig kunt weergeven en kunt werken met sequenties in uw eigen toepassingen. Wat is er nieuw in deze release: · Nieuwe BCSuffixarray- en BCMCP-klassen voor het construeren van op schijf gebaseerde achtervoegselarrays van sequenties en het vinden van de maximale veelgebruikte voorvoegsels van sequenties met behulp van die achtervoegselarrays. · Nieuwe BCCachedingceBile- en BCCachedFastafile-klassen die het lezen van sequentiegegevens kunnen lezen zonder de hele reeks in het geheugen te lezen. Dit is handig voor het werken met zeer grote sequenties zoals hele genomes. Een toekomstige afgifte ondersteunt een BCCachedingcece die een consistente reeks-interface biedt, ongeacht of de sequentie in het geheugen of in de cache op schijf staat. · Bestandsindeling kan explicueren worden geleverd aan BC SERVERENCEREADER met BCFileFormat. · Documentatie-updates. · Meer complete poort naar GNUTEP, alle BCFoundation-functionaliteit moet beschikbaar zijn. · Quad-FAT-binaire ondersteuning van 32/64-bit en PPC / Intel-processors.


Biococoa Gerelateerde software