Bioimagexd Gratis Open Source Software voor analyse en visualisatie van multidimensionale biomedische afbeeldingen
Download nu

Bioimagexd Rangschikking & Samenvatting

Bioimagexd Tags

analyseren analyse analys Analyseer biomediale afbeelding visualiseren image biomedische Biomedische beeldanalyse

Bioimagexd Beschrijving

Gratis open source software voor analyse en visualisatie van multidimensionale biomedische beelden BioImageXD is een gratis open source software die u zullen helpen u bij het analyseren, verwerken en maken multi-dimensionaal, multi datakanaal, time beeld reeks gegevens van microscopie en andere bronnen. Hier zijn een aantal belangrijke eigenschappen van "BioImageXD": Foto's bekijken: imago van de data Open data met elkaar gemeen microscopie formaten (of beelden of stapels van afbeeldingen en tijdreeksen), en bekijken door beeld. Ondersteunde data formaten zijn onder andere: · Carl Zeiss .lsm bestanden · OlympusFV1000 .oif · Leica confocale microscoop gegevensbestanden SP2 .txt en SP5 .lif · Genummerde image stacks import · VTK XML Afbeeldingsbestanden · Afbeelding bekijken is ruwweg vergelijkbaar met de vrije Carl Zeiss en andere confocale fabrikant image viewers, maar met een betere 3D-rendering. Weergavemodi avaialble zijn: Schijfjes, orthografische secties, maximale intensiteit projectie en 3D rendering. Tijdreeksen data worden ondersteund. Afbeelding verwerken: · Stel de kleur / helderheid / contrast / gamma, kleur veranderen of palet van een dataset / kanaal filteren ruis corrigeren voor fluorescentie bleken in tijdreeksgegevens. · 3D-segmentering en object ananlysis. 3D volume rendering: · 3D datasets kan interactief zijn volume weergegeven, met behulp van · Software ray casting (langzamer maar mooiste. Acellerated door het hebben van een groot aantal processors) · OpenGL grafische kaart texture mapping (sneller maar lagere resolutie - afhankelijk van de textuur menory grootte) · TeraRecon Inc. VolumePro1000 hardware ray casting board (ondersteuning in ontwikkeling) · De overdrachtsfuncties kleur en ondoorzichtigheid worden volledig door de gebruiker gedefinieerd. U kunt het volume maken een samengevoegd multi-channel RGB dataset te colocalisation zien in 3D, of maken een 3D-colocalisation kaart. BioImageXD gebruikt de VTK-interface met OpenGL. We zijn van plan om Hardware Stereo bekijken (quad gebufferd pagina omdraaien en rood-blauw anaglyph, en andere modi) mogelijk te maken. Je zult in staat om uit te breken die 3D-bril en echt "zien" van uw gegevens! Dit is de toekomst van 3D-microscopie. Film maken: · Gebruik de Animator module voor het opzetten van een camera pad rond uw 3D-gegevens, en maak een filmpje van te spinnen en vliegen al zoomen zoals u het wenst. Tijdreeksen gegevens worden ondersteund: "4D data". · Colocalisation analyse · Wij weten alles wat je biologen met behulp van confocale microscopie cel zijn altijd op zoek naar colocalisation! Onze colocalisation tool kunt u het colocalisation van signaal intensiteit te analyseren in een multi-channel 3D-data set, het probleem van de valse colocalisation gezien in z-stack projectie beelden te vermijden, en het uitvoeren van een aantal statistische analyses die je harde cijfers geven over de hoeveelheid en de kwaliteit van colocalisation in uw gegevens. Gebruikt dezelfde algoritmen die in ImageJ bijvoorbeeld de WCIF plugin voor automatische Colocalisation Drempels, volgens de methode van Costes et al. · Manders coëfficiënten en statistische significantie analyse met 2D histogram / puntenwolk en de resultaten statistieken export

Bioimagexd Gerelateerde software