Bndlst BNDLST - LIJST Connectiviteitsinformatie voor atomen in een PDB-bestand
Download nu

Bndlst Rangschikking & Samenvatting

Bndlst Tags

lijst lister connectiviteit Lijst connectiviteit connectiviteit lister Atom-connectiviteit

Bndlst Beschrijving

BNDLST - LIJST Connectiviteitsinformatie voor atomen in een PDB-bestand BNDLST is een gratis app die connectiviteitsinformatie op te geven voor atomen in een PDB-bestand.bndlst leest een PDB-formaatbestand en drukt voor elk atoom een lijst af van covalente en H-gebonden naburige atomen, samen met verschillende atomaire eigenschappen. Een record wordt voor elk atoom uitgevoerd, gevolgd door een record voor elk atoom dat is verbonden met, beëindigend in een EOL-record-signalering het einde van de lijst. Standaard worden alleen de H-obligaties en covalente gebonden buren vermeld. Als alternatief, door de -neighbors, -rad # en -cut # te gebruiken, is het mogelijk om niet-gebonden niet-Hbonds te tonen en niet te laten zien in de hechte gebonden Atoms.bndlst kan erg handig zijn als men scripts moet bouwen die atomaire structuren verwerken.

Bndlst Gerelateerde software