CLC Bioinformatics CUBE CLC Bioinformatics Cube Runs Smith Waterman tot 125 keer sneller dan een 3 GHz Desktop-computer
Download nu

CLC Bioinformatics CUBE Rangschikking & Samenvatting

CLC Bioinformatics CUBE Tags

Snelheid toename bio-informatica Bioinformatics Work Blast-Like Search Verhoog de snelheid van de bio-informatica

CLC Bioinformatics CUBE Beschrijving

CLC Bioinformatics CUBE loopt Smith Waterman tot 125 keer sneller dan een 3 GHz Desktop-computer Door innovatief gebruik van FPGA-technologie hebben we een kubus gemaakt die Smith Waterman tot 125 keer sneller loopt dan een 3 GHz-desktopcomputer, en aanvaardbaar dicht bij de snelheid van de Blast. Smith Waterman-zoekopdrachten die 14 uur op het bureaublad nemen, worden aldus gereduceerd tot ongeveer 7 minuten op de CUBE. Dit is een doorbraak voor bio-informatiek desktop-gebaseerde bio-informatica, omdat het onderzoekers de mogelijkheid geeft om explosie-achtige zoekopdrachten aan een aanzienlijk hogere kwaliteit te gebruiken dan voorheen. Onze vergelijking tussen Blast en Smith Waterman laat zien dat het uitvoeren van Blastp met de standaardverwachtingwaarde van 10 vaak resulteert in slechts één keer zoveel hits als een Smith Waterman zoeken op de kubus. Bovendien kunt u door de CUBE in plaats van Blast te gebruiken, kunt u de kwaliteit van de gegevens verbeteren waarmee u werkt! Hier zijn enkele belangrijke kenmerken van "CLC Bioinformatics Cube": · Deze innovatieve benadering van FPGA-gebaseerde hardware- Accelerated Bioinformatics biedt flexibiliteit op verschillende manieren: · Fysieke locatie: geen behoefte aan een gekoelde serverruimte. Alles wat je nodig hebt, is een kleine kamer op je bureau. · Besturingssysteem: verbinding maken met elk type computer via de USB-poort, of het nu gaat om Mac OS X, Linux of Windows. · Software-gebruik: de bio-informatiekubus kan worden gebruikt Een geïntegreerd onderdeel van de werkbanken van alle CLC BIO of via een opdrachtregelinterface. · U kunt zelfs de kubusworkflow aanpassen door gespecialiseerde kubusplug-ins te ontwikkelen met behulp van onze softwareontwikkelaarset. · Prestaties per dollar: u krijgt een ongeëvenaarde Prestaties per dollar, vergeleken met bestaande hogesnelheidsoplossingen op de markt. Wat is er nieuw in deze release: · Vaste crash op zeer specifieke querysequenties.

CLC Bioinformatics CUBE Gerelateerde software