CLC Hoofdwerkbank BIOINFORMATICS-programma voor geavanceerde eiwit- en DNA-sequentie-analyse.
Download nu

CLC Hoofdwerkbank Rangschikking & Samenvatting

CLC Hoofdwerkbank Tags

analyse bio-informatica DNA DNA-analyse bio-informatica eiwitsequentie

CLC Hoofdwerkbank Beschrijving

Bioinformatics-programma voor geavanceerde eiwit- en DNA-sequentie-analyse. Deze 2 x 2 weken van volledig functionele demo van CLC-hoofdwerkbank aggregeert alle DNA-sequentiegeanalyses van CLC-gen Workbench en alle eiwitsequentie-analyses van CLC-eiwitwerkbank.CLC Hoofdwerkbank is een hulpmiddel dat alle analyses in één enkele, gebruiksvriendelijke tool integreert en intuïtieve softwaretoepassing. Hier zijn enkele belangrijke kenmerken van "CLC Hoofdwerkbank": · Montage van DNA-sequentiegegevens. · Geavanceerd Primer-ontwerp. · Moleculair klonering. · Automatische SNP-annotatie van sequenties. · Secundaire proteïne-structuurvoorspelling. · Geïntegreerde 3D-moleculaire weergave. · Signaalpeptide-voorspelling (SignalP). · Transmembraan Helix-voorspelling (TMHMM). · Proteïne-familieanalyse (PFAM). · Twee soorten uitlijningen. · Phylogenetica. · Motief zoeken (bekende patronen). · Patroonontdekking (onbekende patronen). · ONTPLOFFING. · Batchverwerking van meerdere analyses in één werkstap. · Dot-plots. · Hydrofobiciteitanalyses. · Antigeniciteitsanalyses. · Zoekopdrachten op Genbank, SwissProt, Trembl en Pubmed. · Gedetailleerd logboek van acties / analyses uitgevoerd. Vereisten: · 256 MB RAM vereist. · 512 MB RAM Aanbevolen. · 1024 x 768 Display aanbevolen. Beperkingen: · 4 weken volledig functionele proefperiode. Wat is er nieuw in deze release: Expressie-analyse: · Vulkaanplaatsen: u kunt nu de waarden kiezen om op de X-as te plotten. Kies tussen "verschil" en "Fold Change". Lees verder... · Tafelweergave van staafpercelen toont dezelfde intervallen zoals weergegeven in het staafstuk. · Generieke importeur voor expressie-array-gegevens in tabelformaat. Lees verder... · Generieke importeur voor expressie-experiment annotatiegegevens in tabelformaat. Lees verder... · Gene Ontologie (GO) -bestanden kunnen nu worden gebruikt om een expressie-experiment te annoteren. Lees verder... · Tagprofilering: u mag geen tagmonsters meer annoteren, alleen experimenten · Zijpaneel van experimenttabel is opnieuw georganiseerd om beter overzicht te bieden. Lees verder... · Openende consensussequentie inclusief hiaten zal ook ns plaatsen voordat de consensussequentie begint en nadat het eindigt Inzet: · U kunt een pad instellen op de standaardgegevenslocatie die wordt gebruikt wanneer de werkbank voor de eerste keer start. Dit is een functie om systeembeheerders te helpen regelen waar nieuwe installaties per standaard hun gegevens opslaan. Lees verder... · Ondersteuning voor het verwijderen van tools die toegang krijgen tot internet (NCBI Blast, update-meldingen enz.). Lees verder... Algemene import en export: · Ondersteuning voor import van complexe regio's van GFF-bestanden · Exporttabellen en rapporten in Excel-indeling. · Invoergedeelte van gebruikershandleiding opnieuw gestructureerd om een beter overzicht te bieden. Lees meer .... Expressiegegevensimporteurs worden nu beschreven in technische details in een apart gedeelte. Lees verder.... · U kunt nu meerdere sequentielijsten in FASTA-formaat exporteren · Geforceerde import van ZIP-bestanden wordt nu ondersteund (het zal de inhoud van het ZIP-bestand forceren) · De standaard importeert nu zowel GZIP- en TAR-bestanden als ZIP · Als een gedwongen import mislukt, zullen er meer technische informatie zijn over wat er mis ging, zodat u een slechte opmaak van de invoerbestanden kunt identificeren · Beide Genbank- en GFF-importeur maken nu verschillende pogingen bij het benoemen van genen die geen gennaam hebben. Het zal iteratief de volgende kwalificatieproeven proberen: "Product", "Locus_Tag", "Protein_ID" en "Transcript_ID" · Bij het importeren van genbankbestanden waarbij de vermelde lengte niet overeenkomt met de feitelijke sequentie, wordt een waarschuwing getoond, maar de sequentie wordt geaccepteerd. · Bij het exporteren in CSV-formaat worden de locale-instellingen gebruikt om te bepalen of komma's of semi-cols als scheidingsteken moeten worden gebruikt (komma die wordt gebruikt voor de VS) · GFF-plug-in is bijgewerkt om complexe annotaties te accepteren Diversen: · Geavanceerde typing van annotaties met behulp van de annotatietabel. Lees verder... · Verbeterde rapportage van situaties waarin een volledige schijf voorkomt dat gegevens worden bespaard · Sequenties downloaden met behulp van Drag en Drop van de zoektabel maakt niet langer een "Downloading ..." knooppunt in de map. Het downloadproces kan worden gecontroleerd in het tabblad Processen. · Primer-ontwerp ondersteunt nu PCR-fragmenten langer dan 5000 bp. · Extractequenties verplaatst van bestand Manu naar Toolbox-> Algemene sequentie-analyse. Lees verder... · Betere vooruitgang feedback op verschillende dialogen Bugfixes: · Vast probleem met het label "Kopiëren ..." wanneer u gegevens kunt kopiëren en vervolgens de map bijwerken · Vast probleem met het benoemen van tabbladen. De fix betekent dat op Windows en Linux-niet-opgeslagen gegevens nu een * krijgen in plaats van het tabblad Naam en cursief te maken. (Dit is altijd het gedrag geweest op Mac OS X).

CLC Hoofdwerkbank Gerelateerde software