CLC RNA Workbench BIOINFORMATICS-programma voor geavanceerde RNA-sequentie-analyse.
Download nu

CLC RNA Workbench Rangschikking & Samenvatting

CLC RNA Workbench Tags

volgorde bio-informatica rna Bioinformatics-programma RNA-sequentieanalyse RNA Workbench

CLC RNA Workbench Beschrijving

Bioinformatica programma voor geavanceerde RNA-sequentie-analyse. De CLC RNA Workbench geeft de gebruiker eenvoudig toegang tot een reeks van complexe algoritmen en opties. RNA secundaire structuren kunnen worden voorspeld met behulp van state-of-the-art vrije energie minimalisering algorithms.CLC RNA Workbench is een bioinformatica programma voor geavanceerde RNA-sequentie-analyse. Alle analyses zijn volledig geïntegreerd in één enkele, intuïtieve en gebruiksvriendelijke software applicatie. Hier zijn een aantal belangrijke eigenschappen van "CLC RNA Workbench": · Secundaire structuur voorspelling. · Grafische weergave en bewerking van secundaire structuur. · Tabelaanzicht structuren en energiebijdragen. · Symbolische voorstelling achtereenvolgens weergeven. · Patroon zoeken. · BLAST zoekopdrachten. · Algemene sequentieanalyse. · Nucleotide analyses. · Sequentiepositionering. · Dot plots. · Virtual gel viewer. Vereisten: · 256 MB RAM nodig. · 512 MB RAM aanbevolen. · 1024 x 768 scherm aan te bevelen. Beperkingen: · 4 weken volledig functionele trial. Wat is er nieuw in deze release: Inzet: · U kunt een pad naar de standaard data locatie die wordt gebruikt ingesteld wanneer de Workbench start voor de eerste keer. Dit is een functie om systeembeheerders te helpen regelen waar nieuwe installaties per standaard hun gegevens opslaan. Lees verder... · Ondersteuning voor het verwijderen van gereedschap toegang tot het internet (NCBI BLAST, updatemeldingen etc). Lees verder... General import en export: · Ondersteuning voor de invoer van complexe regio's uit GFF-bestanden · Export tabellen en rapporten in Excel-formaat. · Import sectie van de gebruikershandleiding opnieuw gestructureerd om beter overzicht te bieden. Lees meer .... Expression data importeurs worden nu beschreven in de technische details in een apart hoofdstuk. Lees verder.... · U kunt nu exporteren meervoudige sequentie lijsten in fasta formaat · Gedwongen import van zip-bestanden wordt nu ondersteund (het zal import dwingen de inhoud van het zip-bestand) · De standaard invoer accepteert nu gzip en tar-bestanden als zip · Als een gedwongen import niet lukt, zal er meer technische informatie over wat er mis ging worden, waardoor je slechte opmaak van de import bestanden identificeren · Zowel Genbank en gff importeur maakt nu een aantal pogingen tot naamgeving genen die geen gen naam hebben. Het zal iteratief proberen de volgende benamingen: "product", "locus_tag", "protein_id" en "transcript_id" · Bij het importeren van genbank bestanden waarin de lengte vermeld komt niet overeen met de eigenlijke volgorde, verschijnt er een waarschuwing, maar de volgorde is geaccepteerd. · Bij het exporteren in csv-formaat, de Locale instellingen worden gebruikt om te bepalen of komma of een puntkomma moet worden gebruikt als delimiter (komma gebruikt voor US locales) · GFF plug-in is bijgewerkt om complexe annotaties accepteren Diversen: · Geavanceerde overtypen van annotaties met behulp van de annotatie tafel. Lees verder... · Verbeterde rapportage van situaties waarin een volledige schijf voorkomt het opslaan van data · Het downloaden van sequenties met slepen en neerzetten van de search tafel niet langer creëert een "Downloading ..." knooppunt in de map. Het downloaden kan worden gecontroleerd in het tabblad Processen. · Extract Sequences verplaatst van het menu Bestand om Toolbox-> General Sequence Analysis. Lees verder... · Betere vooruitgang feedback op verschillende dialogen Bugfixes: · Probleem weergave van de "Kopiëren ..." label bij het kopiëren van gegevens en vervolgens het bijwerken van de folder · Probleem met het benoemen van de tabs. De oplossing houdt in dat op Windows en Linux-opgeslagen gegevens krijgt nu een * in plaats van make de naam van het tabblad vet en cursief. (Dit is altijd het gedrag op Mac OS X geweest).

CLC RNA Workbench Gerelateerde software