Compucell 3D MODELING MILIEU EN PDE SOLVER
Download nu

Compucell 3D Rangschikking & Samenvatting

Compucell 3D Tags

simuleren simulatie PDE SOLVER Modelleeromgeving cellulaire simulatie cellulair

Compucell 3D Beschrijving

Modellerende omgeving en PDE-oplosser Compucell 3D is een open source-modelleeromgeving en PDE-oplosser, die voornamelijk wordt gebruikt om cellulair gedrag te bestuderen. COMPUCELL is in eerste instantie ontwikkeld om onderzoekers (biologen en natuurkundigen) modelmaterialen en weefsels te helpen zonder middelen te hoeven wijden aan het ontwikkelen van code die bestaande software zal reproduceren. De code is gebouwd op C ++ met een Python Wrapper. Gebruikers kunnen eenvoudig modelparameters definiëren in een XML-bestand en de simulatie uitvoeren met onze GUI, de Compucell-speler. Compucell 3D biedt een eenvoudige interface voor complexe modellen en real-time visualisatie van hun simulaties. Vereisten: · Python 2.5 of later Wat is er nieuw in deze release: · Nieuw, opnieuw ontworpen Compucell-speler met stuurmogelijkheden, vermogen om · Replay eerder opgeslagen simulatieresultaten, betere grafische weergave met VTK · En vele andere verbeteringen. Ingevoegde mogelijkheid om nieuwe soorten gebruikers- · Gedefinieerde en gebruikersgestuurde velden die in de nieuwe speler kunnen worden weergegeven. · Voor MacOS distribueren we kleine, maar nuttige toepassing geschreven door David Larson · Hiermee kunnen gebruikers experimentele foto's pixelen en deze omzetten in PIF · Initialisatiebestanden. Gebruikers "verf" het experimentele beeld en toewijzen cel · Typen voor de geschilderde regio's. · Experimentele, externe modules toegevoegd die subcellulaire netwerkenmodellen oplossen · Geschreven in SBML. Deze functie bevindt zich nog in de bètaversie, maar lijkt te integreren · Met CC3D heel goed. We zullen gebruikers bijwerken over onze vooruitgang in dit opzicht. · Mogelijkheid om simulaties uit te voeren in een stille modus (niet met behulp van speler). De resultaten zijn · Opgeslagen in het VTK-formaat en kan worden verzonden met behulp van Compucell · Speler of aangepaste geschreven scripts. · Hernoemde plasticiteit tot elasticiteit. Alle simulaties geschreven voor CC3D-versie · Vorige op de huidige en het gebruik van plasticiteit-plug-ins moeten worden bijgewerkt en veranderd · Woord "plasticiteit" tot "elasticiteit". Dit benamingsverdrag komt beter overeen met · Wat deze plug-ins implementeren. · Herstructureerde broncode directory structuur · Nieuwe reactie-diffusie-oplosser waarmee gebruikers aangepaste termen kunnen specificeren en · Vereist geen recompilatie · Bijgewerkte functionaliteit voor elasticiteits-plug-ins, ContactLocalProduct-plug-in, · Talloze bugfixes

Compucell 3D Gerelateerde software