Findpeaks Voert analyse uit op chip-seq-experimenten
Download nu

Findpeaks Rangschikking & Samenvatting

Findpeaks Tags

analyseren experiment analys Analyseer Experiment Experimentanalyse Chip-SEQ-experiment

Findpeaks Beschrijving

Voert analyse uit op experimenten met chip-seq VindPeaks is een gratis software ontwikkeld om analyse van chip-SEQ-experimenten uit te voeren. Het vinden van een naïef algoritme voor het identificeren van gebieden met hoge dekking, die chromatine-immunoprecipitatie-verrijking van sequentierfragmenten weergeeft, die de locatie van een gebonden eiwit van belangstelling aangeeft. Een minimumhoogte-drempel wordt gebruikt om te bepalen welke "pieken" worden weergegeven in het UCSC-compatibele pruikbestand - als er geen drempel wordt gebruikt, worden alle lezingen weergegeven. Findpeaks verzamelt en sorteert de lezingen langs elke chromosomen en identificeert gebieden met verrijking, "pieken". Deze pieken zijn bijzonder belangrijk bij chromatine-immunoprecipiatie-experimenten (chip-seq of chip-solexa-experimenten), omdat ze de locatie van een gebonden eiwit van belang aangeven. Vereisten: · Java Wat is er nieuw in deze release: · Bugfix: genormaliseerde FDR-waarden

Findpeaks Gerelateerde software