Gambit Viewer A Cross-chique Viewer en Analyse Workbench voor gegevens van de volgende generatie gegevens
Download nu

Gambit Viewer Rangschikking & Samenvatting

Gambit Viewer Tags

visualiseren volgorde analyseren sequentieanalyse sequentiegegevens viewer analyseer chromosoom

Gambit Viewer Beschrijving

Een cross-platform viewer en analysewerkbank voor gegevens van de volgende generatie gegevens De Gambit-viewer is een nieuwe grafische gebruikersinterface (GUI) -toepassing die u beoogt om u te helpen met de sequentie-analyse.De Gambit Viewer-software maakt gebruik van de indexeringsfuncties van de (eerlijk) onlangs gestandaardiseerde BAM-sequentie-uitlijningsindeling die snelle toegang tot genomisch toestaat Gegevens, met minimale opstarttijd en opnieuw renderende vertraging. De Gambit-viewer ondersteunt ook een verscheidenheid aan annotatiediensten (bed, gff, gff3, vcf) "out-of-the-box" voor het weergeven van gen / regio-annotaties en SNP-vermeldingen. De gambit-viewer is momenteel "Plugin-Aware" Met betrekking tot opmeerondersteuning, die ondersteuning voor nieuwe indelingen kan worden toegevoegd zonder het hoofdprogramma zelf te hoeven wijzigen / te upgraden.Bio-informatica-analyse van sequentiegegevens vereist momenteel gespecialiseerde expertise en wordt snel een knelpunt. Analyse-behoeften van kleinere biologische laboratoria kunnen worden bediend als de visualisatiesoftware essentiële analytische functionaliteit integreert. Dergelijke functionaliteit omvat PCR-primerontwerp om kandidaat SNP-validatie-experimenten te ondersteunen; verbinden met gemeenschappelijke databases; Gegevens exporteren van specifieke regio's van het chromosoom voor gedetailleerde en gerichte analyse. De gambit-viewer zal binnenkort "plugin-aware" zijn met betrekking tot analytische hulpmiddelen om dergelijke geïntegreerde functies te bieden. Eén voordeel van het implementeren van het analysesysteem via plug-ins is dat iedereen met programmeervaardigheden gemakkelijk hun eigen aangepaste functies kan omvatten: ondersteuning voor nieuwe bestandsindelingen, aanvullende statistieken of zelfs aangepaste weergaven. Een ander voordeel is dat gebruikers niet elke plug-in toevoegen. U kunt de Gambit-viewer aanpassen als lichtgewicht of volledig functioneel als uw behoeften vereisen. Vereisten: · Java

Gambit Viewer Gerelateerde software