Goaxexplorer
Download nu

Goaxexplorer Rangschikking & Samenvatting

Goaxexplorer Tags

vergelijken genoom taxonomie genoomvergelijking Vergelijkende genomica Taxonomische classificatie

Goaxexplorer Beschrijving

Hiermee kunt u een taxonomische classificatie maken GotaxExplorer is een gratis en gemakkelijk te gebruiken software die een nieuwe aanpak van vergelijkende genomica presenteert die functionele informatie en gezinnen integreert met de Taxonomic Classification.GotaxExplorer, integreert Uniprot, Gene Ontologie, NCBI Taxonomy, Pfam en Smart in één database. GOTAXEXplorer biedt vier verschillende querystypen: · Selectie van sets · Vergelijking van sets van PFAM-families · Semantische vergelijking van sets van GO-voorwaarden · Functionele vergelijking van sets van genproductenDeze vergunningen om aangepaste sets van GO-termen, gezinnen of taxonomische groepen te selecteren. Het is bijvoorbeeld mogelijk om willekeurige geselecteerde organismen of groepen organismen van de taxonomische boom te vergelijken op basis van de functionaliteit van hun genen. Bovendien maakt GotaxExplorer mogelijk om de verdeling van specifieke moleculaire functies of eiwitfamilies in de taxonomie te bepalen. De vergelijking van sets van GO-voorwaarden maakt het mogelijk om de semantische overeenkomst van twee verschillende GO-voorwaarden te beoordelen. De functionele vergelijking van genproducten maakt het mogelijk om functioneel equivalent en functioneel gerelateerd genproducten te identificeren van twee organismen op basis van Go Annotations en een semantische gelijkmatigheidsmaatregel. Deze methode is onafhankelijk van sequentie-overeenkomst en daarom in staat om functioneel equivalent of functioneel gerelateerde eiwitten te vinden die niet homoloog zijn. Vereisten: · Java 1.6 of later

Goaxexplorer Gerelateerde software