Imas Een gratis systeem voor de ontdekking van kennis in genomische informatie
Download nu

Imas Rangschikking & Samenvatting

Imas Tags

analyseren Ontdek genoom analyseren genoom Visual Analytics genoomontdekking

Imas Beschrijving

Een gratis systeem voor de ontdekking van kennis in genomische informatie IMAS (het interactieve multigenomische analysesysteem) is een gratis en open source visuele analytische systeem voor de ontdekking van kennis in genomische informatie. IMAS stelt genomische wetenschappers in staat om snel een reeks microbiële genomische sequenties te analyseren met behulp van hulpmiddelen zoals glans, explosie, clustalw, primer3 en transport en om de uitvoer van deze hulpmiddelen in een verenigd genomisch framework te visualiseren. AMA's biedt de gebruiker een 1-dimensionale zoomen grafische interface naar een genomische reeks. De gebruiker kan communiceren met de sequentie om te analyseren op de aanwezigheid van coderende regio's, die verder kunnen worden geanalyseerd door sequentie-uitlijning met lokale en externe databases met behulp van BLAST. Blast-resultaten worden weergegeven in een uniform grafisch raamwerk waarmee de gebruiker kan worden gefiltreerd en om BLAST-hits van interesse te selecteren. Geleefde Blast-hits kunnen dan multiigned worden gebruikt met behulp van Clustalw, en deze multiignaties worden weergegeven met behulp van het gemeenschappelijk grafisch kader. Multiignments en paarsgewijze afstemming kunnen worden geannoteerd door de gebruiker voor toekomstige referentie- en HTML-rapporten kunnen worden gegenereerd met deze bevindingen.

Imas Gerelateerde software