Lalnview Gereedschap om lokale uitlijningen tussen twee sequenties te visualiseren
Download nu

Lalnview Rangschikking & Samenvatting

Lalnview Tags

visie kijker uitlijning Sequence-uitlijning Bekijk uitlijning uitlijning kijker

Lalnview Beschrijving

Tool om lokale uitlijningen tussen twee sequenties te visualiseren LALNVIEW is een gratis en open source grafisch programma voor het visualiseren van lokale uitlijningen tussen twee sequenties (eiwit of nucleïnezuren). Sequenties worden weergegeven door gekleurde rechthoeken om een algemeen beeld te geven van de overeenkomsten tussen de twee sequenties. Blokken van gelijkenis tussen de twee sequenties zijn gekleurd volgens de mate van identiteit tussen segmenten.LALNVIEW is ook in staat om sequentie-functies (actieve site, domein, motief, propeptide, exon, intron, promotor, etc.) samen met de uitlijning weer te geven. Hierdoor kan iemand het verband maken tussen sequentie-gelijkenis als bekende functies. Bij gebruik van LALNVIEW via deze servers worden sequentiesfuncties automatisch geëxtraheerd uit databaseannotaties en weergegeven met de uitlijning. Volledige tekstsequenties worden weergegeven in een secundair venster. Door op een blok op een blok te klikken, kan de gebruiker het bijbehorende lokale uitlijning visualiseren. Het domein kan in een reeks worden herhaald, iteratief die op één blok klikt, meteen alle vergelijkbare blokken weergeeft die in de andere sequentie voorkomen.

Lalnview Gerelateerde software