LigandScout Softwareapplicatie voor Advanced Pharmacophore-modellering
Download nu

LigandScout Rangschikking & Samenvatting

LigandScout Tags

overlay molecuul Molecuulcomplex Generatie van farmacophore farmacofoor overlay farmacophore

LigandScout Beschrijving

Softwareapplicatie voor Advanced Pharmacophore-modellering LigandScout is een softwaretool waarmee 3D-farmacophores snel en transparant kunnen ontlenen aan structurele gegevens van macromolecule / ligand-complexen op een volledig geautomatiseerde en handige manier. De algoritmen zijn wetenschappelijk gepubliceerd en gebaseerd op verschillende jarenlange ervaring in de creatie van farmacofore , terwijl de toepassing overeenkomt met state-of-the-art informatietechnologie. Ondersteuning voor verschillende gemeenschappelijke farmacophore-indelingen zoals de export naar CatalystTM, Moetm of PhasetM garanderen maximale interoperabiliteit aan screeningplatforms. De full-featureled 3D-grafische gebruikersinterface met meerdere undo-niveaus maakt de verkenning van de actieve site en het maken van farmacophore binnen het complex transparant en efficiënt. Bindende site-analyse, op farmacophore gebaseerde uitlijning en het maken van gedeelde feature-farmacophores zijn ontworpen om LigandScout een essentieel hulpmiddel te maken voor op structuur gebaseerd medicijnontwerp in combinatie met virtuele screening. LigandScout wordt uitgevoerd op alle gangbare besturingssystemen. Er zijn enkele belangrijke functies van "LigandScout":? Automatische interpretatie van PDB-liganden met behulp van geometrie, woordenboeken en regels? State-of-the-art gebruikersinterface met geavanceerde 3D-graphics en ongedaan maken? 2D Bekijk en hiërarchische weergave direct gekoppeld aan 3D-interface? Snelle uitlijning van moleculen in hun bio-actieve conformatie aan andere moleculen en 3D-farmacophoren uit verschillende liganden en / of farmacophores, kunnen gedeelde feature-farmacophores worden afgeleid om de relevante manier van handelen te begrijpen en te modelleren? Geavanceerde afhandeling van co-factoren, ionen, watermoleculen en covalent gebonden ligands? Farmacophore Exporteren naar Catalyst (TM), Moe (TM) en fase (TM) voor virtuele screening? Uitgebreide parametercontrole voor meer ervaren gebruikers? Geavanceerde PDB Ligand-perceptie en eenvoudige handmatige correctie tijdens het modelleren op de actieve site? Mogelijkheid om co-factoren en watermoleculen te behandelen als onderdeel van het ligand of een deel van de macromolecule? Intuïtieve farmacophore-gebaseerde uitlijning van moleculen? Ondersteuning voor de meest voorkomende bestandsindelingen? Geavanceerd bestand en repository management van bewerkte en opgeslagen bindingsplaatsen, moleculen en farmacophoresrequirements:? Ten minste 512 MB RAM (1 GB aanbevolen)? Java 1.5 Runtime-omgeving? Hardware-versnelde 3D-grafische kaart (Nvidia of ATI-aanbevolen) met OpenGL 1.2 Ondersteuningsbeperkingen: · 30 dagen proef

LigandScout Gerelateerde software