Locomotief

Software voor de lokalisatie van RNA-motieven
Download nu

Locomotief Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • Janina Reeder
  • Uitgever website:
  • http://www.techfak.uni-bielefeld.de/ags/pi/pages/janina.htm
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X
  • Bestandsgrootte:
  • 1 KB

Locomotief Tags


Locomotief Beschrijving

Software voor de lokalisatie van RNA-motieven Locomotif is een gratis software die kan worden gebruikt voor de lokalisatie van RNA-motieven met gegenereerde thermodynamische matchers.locomotif is een GUI-gebaseerd programma dat het visuele ontwerp van RNA-motieven mogelijk maakt. De grafische structuren worden vervolgens vertaald in uitvoerbare programma's die moeten worden gebruikt voor het zoeken naar een motief in een reeks (platte tekst of FASTA-formaat). Structuur een afgewerkte structuur (met alleen de open 5 'en 3' uiteinden): · Gebruik de linkerknoppen aan Kies een bouwsteen. Plaats de eerste bouwsteen op het canvas door een muisklik. Voeg later toe aan de beschikbare open uiteinden of gebruik ze om nieuwe structuuronderdelen te starten. · Enkele strengen kunnen alleen worden gebruikt in gesloten structuren met slechts één open uiteinde links per structuurdeel. Dan kunnen ze worden gebruikt om het 5 'of 3'-uiteinde te verlengen of om een van deze met verschillende structuuronderdelen aan te sluiten. · Gebruik de bovenste knoppen voor het bewerken van bewerkingen op het genereren van de motief.matcher: · Gebruik van het menu "Vertaling-> Verzenden XML ", stuur de XML-code naar onze server voor vertaling op de server. U krijgt een BibiServ-ID zodra de compilatie is voltooid. Dit kan enige tijd duren! Running the Matcher: · U kunt het gegenereerde Matcher-programma rechtstreeks via LOCOMOTIFUS uitvoeren met behulp van het menu "Matcher-> volgorde uitvoeren". Als alternatief kunt u de inzendpagina samen met de verkregen ID gebruiken. · Specificeer een reeks in platte tekst of FASTA-indeling en upload deze op de server. · · Resultaten worden aan u gepresenteerd in Locomotif of op een webpagina afhankelijk van uw inzendingskeuze. Vereisten: · Java 1.2.2 of later


Locomotief Gerelateerde software