Matgat
Download nu

Matgat Rangschikking & Samenvatting

Matgat Tags

genereren Matrix gelijkenis matrixgenerator gelijkmatige matrix matrixgeneratie

Matgat Beschrijving

Een eenvoudige gelijkenis / identiteitsmatrixgenerator in Java Matgat (Matrix Global Alignment Tool) is een gratis en eenvoudig, gemakkelijk te gebruiken gelijkenis / identiteitsmatrixgenerator. Matgat berekent de gelijkenis en identiteit tussen elk paar DNA- of eiwitsequenties in een bepaalde gegevensset zonder vooraf uitlijning van de gegevens te hebben. Matgat voert een reeks paar-wijze uitlijningen uit, berekent gelijkenis en identiteit en plaatst vervolgens de resultaten in een afstandsmatrix. Gegevens kunnen in Matgat worden ingevoerd als een knip- en plakfunctie of met behulp van een browse-functie voor grotere bestanden. Bestanden moeten duidelijke tekst zijn in het standaard FASTA-formaat met meerdere sequentie-analyse als elk een FASTA-titelregel is die begint met ">". Bestanden van maximaal 100 DNA- of eiwitsequenties zijn met succes geanalyseerd met behulp van Matgat. De gebruiker kan specificeren welk type uitlijningsmatrix (BLOSUM, PAM, enz.) Hij kan willen gebruiken met zijn DNA- of eiwitsequenties. Vereisten: · Java Wat is er nieuw in deze release: · Tijdens de uitlijning Matrix-export op versie 2.01 en eerder was de laatste kolom niet · Geëxporteerd, fixeert deze versie deze fout.

Matgat Gerelateerde software