Maxplorer MaExplorer - op Java gebaseerde data-mijnbouwfaciliteit voor cDNA of oligonucleiotide microarray-databases
Download nu

Maxplorer Rangschikking & Samenvatting

Maxplorer Tags

data mijner gen cDNA CDNA-gegevensminer gen genanalyses

Maxplorer Beschrijving

MaExplorer - op Java gebaseerde data-mijnbouwfaciliteit voor cDNA- of oligonucleiotide microarray-databases MaExplorer (Microarray Explorer) is een op Java gebaseerde data-mining-faciliteit voor cDNA- of oligonucleiotide microarray-databases. De verkennend gegevensanalyseomgeving biedt hulpmiddelen voor de data-mining van kwantitatieve expressieprofielen in meerdere microarrays.microarray-gegevens kunnen worden bekeken en direct gemanipuleerd in array pseudoimages, scatter-plots, histogrammen, expressieprofielen, clusteranalyses (vergelijkbare genen, k-middelen of K-mediane, hiërarchische clustering, enz.) en rapporten. Een sleutelfunctie is de gene-filters voor het beperken van een werkreeks genen tot diegenen die een verscheidenheid aan door gebruiksgestelde tests en voorwaarden zijn. Rapporten kunnen worden gegenereerd met hypertekst webtoegang tot genomische databases zoals Unigenen, LocusLink, DBEST, NCI / CIT MADB MICROARRAY-database, afbeelding, genbank en andere internetdatabases voor sets genen die van belang zijn. Een belangrijke focus van deze tool Is interactieve datamining met toegang tot andere ondersteunende webgenomische databases. De nadruk op directe manipulatie van genen en sets van genen in grafische tafels biedt een hoog interactie met de gegevens die het gemakkelijker maken voor onderzoekers om ideeën te testen wanneer u op zoek bent naar patronen. De MaExplorer Open Java API is beschikbaar voor het maken van uw eigen Java Maeplugins . Hiermee kunt u uw eigen analytische gereedschappen toevoegen, evenals die door andere onderzoekers gecreëerd om MaExplorer-functionaliteit uit te breiden. Deze kunnen het toevoegen van nieuwe analysemethoden aan het basissysteem, zoals statistische tests, normalisatie, clustering, client-server, enz. MHERE zijn enkele belangrijke kenmerken van "MaExplorer": · Analyseer de expressie van individuele genen; · Analyseer de expressie van genfamilies en clusters; · Vergelijk expressiepatronen en uitbijters; · Rechtstreeks toegang tot andere genomische databases voor genen van belang.Note: MaExplorer wordt vrijgegeven onder de Mozilla Public License 1.1 (MPL 1.1).

Maxplorer Gerelateerde software