Mesa Macro-evolutionaire analyse en simulatiepakket
Download nu

Mesa Rangschikking & Samenvatting

Mesa Tags

analyseren simuleren evolutie evolutie analyse simuleren evolutie evolutie simulatie

Mesa Beschrijving

Macro-evolutionaire analyse en simulatiepakket Phylogenies zijn guns. Een evolutionaire geschiedenis draagt in zijn vorm de vingerafdrukken van elk proces dat zijn creatie bewerkstelligt: uitsterving, belangrijke aanpassingen, stralingen, kolonisaties, veranderingen in het tempo en de modus van macroevolutie. Helaas is het analyseren van fylogenies moeilijk. De berekeningen van interesse voor elke onderzoeker zijn soms ingewikkeld en arbeidsintensief. Ze zijn ook vaak in verschillende programma's, als er überhaupt een software-implementatie is. De statistische significantie van resultaten vereisen vaak de vergelijking van honderden tot duizenden bomen. Ten slotte kunnen metrics kwetsbaar zijn voor de ontwikkelingsmodus, groeide een fylogenie onder. Het resultaat van deze problemen is dat fylogenetische analyse vaak hard werken is, en het is moeilijk om te weten wat te maken van de antwoorden. Mesa is een softwareprogramma gemaakt om deze problemen te verlichten. Hoewel Mesa echt slechts vier dingen doet, is de grote overwinning voor zijn gebruikers dat al deze in één softwarepakket zijn en kunnen worden gebruikt in combinatie met elkaar, en semi-geautomatiseerd.thus, de problemen van het overbrengen van gegevens tussen programma's en mogelijke corruptie of verkeerdepretatie van resultaten worden vermeden.Note: Mesa is niet gerelateerd aan de grafische bibliotheek, spreadsheet, luchtvaartmaatschappij, academische associatie, universiteit, zoekmachine, technische maatschappij, stad of topografische kenmerk van dezelfde naam. Hier zijn enkele belangrijke kenmerken van "Mesa": Manipulaties: · MESA kunnen datasets in geavanceerde manieren worden gemanipuleerd. Phylogenetische bomen en levensgeschiedeniskenmerken kunnen worden bewerkt, gedupliceerd of verwijderd. Taklengten kunnen systematisch worden gewijzigd, taxa verwijderd volgens complexe omstandigheden, kenmerkend gewijzigd en selectief gewijzigd. De hele dataset kan ook worden ondersteund en op elk moment gerestaureerd. Analyse: · MESA bevat een groot aantal berekeningen die diversiteit binnen een fylogenie (bijv. Phylogenetische diversiteit), diversiteit tussen gemeenschappen (bijv. SHANNON-Weiner-index), maatregelen van macroevolutionair proces (bijv. Fusco-CRONK-onevenwichtigheid), kunnen (bijv. . SIMULATIES: · MESA maakt het mogelijk dat fylogenies worden gekweekt onder geavanceerde scenario's waar speciatie- en uitstervenspercentages kunnen worden uitgevoerd door de kenmerken van de betrokken taxa of globale attributen van de fylogenie. Simulaties kunnen verder worden versierd door massa-uitsterven en de evolutie van de eigenschappen van de levensgeschiedenis. Automatisering: · Om de productie en het testen van een groot aantal fylogenies mogelijk te maken, kunnen MESA gebruikers kettingen van acties construeren (manipulaties, analyses en simulaties) die kunnen worden uitgevoerd als een enkele eenheid, looping van groepen opdrachten, het opslaan en herstellen van gegevens. Zo kan men gemakkelijk testen een groot aantal replicates genereren voor statistische validiteit. Wat is er nieuw in deze release: · Voor obscure technische redenen (line-eindes en leesmodi), zou de pc-versie van Mesa weigeren om sommige bestanden te lezen die prima op de Mac waren gelezen. Het lijkt nu te worden opgelost. Dank aan Henri voor het identificeren van dit probleem.

Mesa Gerelateerde software