Methemarker Rangschikking & Samenvatting
- Naam uitgever:
- Max-Planck-Institut Informatik
- Uitgever website:
- http://methmarker.mpi-inf.mpg.de/
- Besturingssystemen:
- Mac OS X
Methemarker Tags
Methemarker Beschrijving
Vergemakkelijkt het ontwerp en de optimalisatie van DNA-methylatie-assays Methmarker is een eenvoudig te gebruiken programma dat het ontwerp en de optimalisatie van gen-specifieke DNA-methylatie-assays vergemakkelijkt. Naast het gebruik als een epigenetische primer-ontwerptool, biedt het uitgebreide ondersteuning voor epigenetische biomarker-optimalisatie. Voor een gegeven gen of genomische regio helpt Methmarker DNA-methylatie-assays te ontwerpen voor een van de volgende protocollen: · Cobra (gecombineerde bisulfietbewerkingsanalyse) · BISULFITE SNUPE (Single Nucleotide Primer-extensie) · Bisulfietpyrosequencing · MSP (methylatiespecifieke polymerasekettingreactie) · Methylight · MediP-QPCR · Andere methoden (bijv. Massarray) via de aangepaste assay featurefurdermore, als DNA-methyleringsprofielen beschikbaar zijn voor de regio van belang , Methmarker kan worden gebruikt om DNA-methyleringsbiomarkers te optimaliseren en te valideren die robuuste classificatie bieden, bijvoorbeeld tussen tumormonsters en een gezond bedieningsweefsel. Vereisten: · Java 1.5 of later
Methemarker Gerelateerde software