NCL Gratis en Open Source Nexus Class Library voor uw Mac
Download nu

NCL Rangschikking & Samenvatting

NCL Tags

bibliotheek C++-bibliotheek interpreteren Nexus Library Interpreteer Nexus-bestand verband

NCL Beschrijving

Gratis en open source Nexus klasse bibliotheek voor uw Mac NCL een C ++ bibliotheek voor het interpreteren van data bestanden die zijn gemaakt volgens de NEXUS bestandsformaat dat gebruikt wordt in de moleculaire evolutie en fylogenetische systematiek. Wat is er nieuw in deze release: bug fixes (zichtbaar voor eindgebruikers): · Opening bestanden in binaire modus (niet te doen problemen veroorzaken met het einde van hun lijn en andere speciale tekens). · Karakter index (in plaats van 0-based dan 1 gebaseerde nummer) werd gedrukt in sommige contexten in foutmeldingen · Apple g ++ - 4.2 optimalisatie bug heeft nu een tijdelijke oplossing · Figuren blokken nu verwerpen bestanden waarin het datatype DNA, RNA of eiwit Indien symbolen worden toegevoegd. bug fixes API: · Vaste instelling NXS_HAS_ALL_TAXA_BIT niet langer dupliceren blokkeert wanneer dezelfde lezer wordt gebruikt om meer dan een bestand gelezen · Waardoor PublicNexusReader :: Voeg genoemd te worden · Sommige Windows-specifieke wijzigingen op de waarschuwingen en fouten te compileren onder Visual Studio 2008 (VC9) te voorkomen · Tekens blok genereert nu een uitzondering als er geen matrix · NxsReader :: BlockIsASingeltonReader probleem opgelost · Beter opruimen in de multiformat lezer wanneer er een fout in het lezen van een bestand · Een andere accessor toegevoegd NxsSimpleTree · PublicNexusReader GetXXXBlock functies veranderd om terug te keren 0L in plaats van een uitzondering te verhogen als je een blok die buiten het bereik te vragen · NCL_CONST_FUNCS macro toegevoegd API-toevoegingen: · Verbeteringen aan PHYLIP lezen - matchchar nu geaccepteerd (multiformat reader only). · Het lezen van een enkele kale Newick boom (als "phyliptree" of "relaxedphyliptree" in multiformat reader stuff). · Toegevoegd cullIdenticalTaxaBlocks () functie nexusreader. U moet deze bellen voordat het lezen van een bestand als u wilt dat alle herhaalde taxa blokken om vernietigd te worden in plaats van opgeslagen · Ondersteuning voor genetische codes en de vertaling naar aminozuren toegevoegd · GetEscapedDouble en GetEscapedInt toegevoegd · GetDatatypeMapForMixedType toegevoegd · Extra functionaliteit aan identieke taxa blokken, zelfs als ze zijn impliciete blokken te verwijderen. Dit zal alleen worden geactiveerd als de client-code NxsReader :: cullIdenticalTaxaBlocks heeft genoemd (true). Deze corrigeert een probleem DZ zag met het lezen van meerdere datablokken · Aliasing van het blok titels voor geruimd blokken Veranderde · het hanteren van het + teken wanneer een nxstoken Zo is gewijzigd door een aanroep indictate hyphenNotPunctuation in effecet (dit geschiedt via de SetLabileFlagBit functie). In vrijwel alle gevallen deze functie wordt zodat een aantal (in het bijzonder een writtend wetenschappelijke notatie wordt gelezen als een token, dan wel 4 tokens). In zeldzame gevallen, wordt de + gebruikt voor de exponent of voor het gehele getal. Dus dat client-code niet hoeft te gaan met deze gevallen is het standaard gedrag is veranderd in het gebruik van de hyphenNotPunctuation aan te geven dat bij het lezen van het volgende token noch · Noch + moeten worden behandeld als leestekens. Client code die wensen om het oude gedrag gebruiken NCL kan compileren met de NCL_VERSION_2_STYLE_HYPHEN macro gedefinieerd tot en met 1

NCL Gerelateerde software