Padel-adv Gratis software om virtuele screening uit te voeren
Download nu

Padel-adv Rangschikking & Samenvatting

Padel-adv Tags

screening Virtuele screening Adv-screening AutoDockVina recht Autodock

Padel-adv Beschrijving

Gratis software om virtuele screening uit te voeren Padel-Adv is een gratis en eenvoudig te gebruiken Java-software om virtuele screening uit te voeren met behulp van Autodock Vina. Voordat u Padel-Add wilt uitvoeren, moet u het volgende doen: · Maak het receptor PDBQT-bestand voor met behulp van AutODOCKTOOLS. · AutoDOCK VINA-configuratiebestand voorbereiden minstens de volgende informatie (controleer Autodock Vina handleiding voor beschrijving van deze informatie) .a) Receptorb) center_xc) center_yd) center_ze) size_xf) size_yg) size_z · plaats alle ligands-bestanden in een map. Meest voorkomende bestandsindelingen (bijvoorbeeld MDL Mol, Smiles, PDB) en PDBQT-bestanden worden ondersteund. · Voer Padel-Adv, vul alle velden in en druk op de knop Start. Na voltooiing wordt een ZIP-bestand met resultaten en gerelateerde bestanden gecreëerd voor elk ligand. De resultaten van alle liganden worden geconsolideerd in het opgegeven CSV-bestand. Vereisten: · Java 6 of later Wat is er nieuw in deze release: · Wijzig de manier waarop de Ligand.PDB, opgeslagen in het ZIP-bestand, wordt gegenereerd om RMSD-berekeningen te vergemakkelijken.

Padel-adv Gerelateerde software