Poema Een tool voor Bayesiaanse analyse van Partitioned Model Adequaatheid
Download nu

Poema Rangschikking & Samenvatting

Poema Tags

analyseren analyse bayesian Bayesiaanse analyse

Poema Beschrijving

PUMA is een op Java gebaseerde applicatie die de toereikendheid van fylogenetische modellen van sequentie-evolutie in een Bayesiaanse context beoordeelt door een achterste voorspellende simulatie te gebruiken. De nauwkeurigheid van Bayesiaanse fylogenetische gevolgtrekking met molecuulgegevens is aangetoond dat het afhangt van het gebruik van de juiste modellen van sequentie-evolutie. Tijdens het kiezen van het beste model dat verkrijgbaar is bij een pool van alternatieven is standaardpraktijk geworden in statistische fylogenetica, de beoordeling van de toereikendheid van het gekozen model zeldzaam. Programma's voor Bayesiaanse fylogenetische gevolgtrekking zijn onlangs begonnen met het implementeren van modellen van sequentie-evolutie die de heterogeniteit in proces op het gebied van sites vertegenwoordigen, maar er is geen programma om de toereikendheid van deze modellen te beoordelen. PUMA implementeert een achterste voorspellende simulatiebenadering van het beoordelen van de toereikendheid van gepartitioneerde, ongepartitie en mengmodellen van DNA-sequentie-evolutie in een Bayesiaanse context. Beoordeling van modeladmacy maakt empirische fylogenetici mogelijk om passend vertrouwen te hebben in hun resultaten en begeleidt de inspanningen van theoretische fylogenetici in het verbeteren van modellen van sequentie-evolutie.

Poema Gerelateerde software