Pycogent Gratis en Open Source Python Sequence Toolkit
Download nu

Pycogent Rangschikking & Samenvatting

Pycogent Tags

toolkit Python Toolkit Sequence Toolkit pythonsequentie volgorde Pycogent

Pycogent Beschrijving

Gratis en Open Source Python Sequence Toolkit Pycogent is een toolkit voor het begrijpen van een reeks. Pycogent bevat connectoren op afstandsbedieningsdatabases, controllers voor toepassingen van 3e partij en ingebouwde algemene probabilistische technieken voor het werken met biologische sequenties. Vereisten: · Python 2.5.1 of later · Numpy 1.0 of later Wat is er nieuw in deze release: · PYPI INSTALLEER NU WERKEN, Zie Werk rond op Bug 2807542, 2807539 COGENT 1.2 - 1.3 Nieuwe functies · Python2.6 wordt nu ondersteund · Cogent.cluster.nmds toegevoegd, code om niet-metrische multidimensionale schaal uit te voeren. Niet zo snel als anderen (bijvoorbeeld: r, massapakket, isomds) · Documentatie geporteerd tot het gebruik van de Sfinx-documentatie-generator. · Major toevoegingen aan documentatie in doc / voorbeelden. · Gedeeltelijke ondersteuning toegevoegd voor het opvragen van de EnSMBL MySQL-databases. Deze capaciteit heeft extra afhankelijkheden (Mysql-Python en Sqlalchemy). Deze module moet worden beschouwd als alpha-niveaucode, (hoewel het al enige tijd betrouwbaar heeft gewerkt in de handen van de ontwikkelaars). · Introduceer een nieuwe substitutiemodelfamilie. Deze familie heeft dezelfde vorm als die oorspronkelijk beschreven door Muse en Gut.

Pycogent Gerelateerde software