Pyrx Bekijk moleculaire gegevens met deze tool
Download nu

Pyrx Rangschikking & Samenvatting

Pyrx Tags

analyseren analys molecuul molecule viewer drug target-analysator drugsontdekkingsproces

Pyrx Beschrijving

Bekijk moleculaire gegevens met deze tool PYRX is een eenvoudig te gebruiken virtuele screening-applicatie die speciaal is ontworpen voor ontdekking van computationele geneesmiddelen die kan worden gebruikt om bibliotheken van verbindingen te scenken tegen potentiële drugsdoelen. PYRX stelt medicinale chemici in staat om virtuele screeningsformulier een platform uit te voeren en gebruikers in elke stap van dit proces te helpen - van gegevensvoorbereiding op het indienen van opdracht en analyse van de resultaten. Hoewel het waar is dat er geen magische knop is in het drugsontdekkingsproces, bevat PyrX Docking Wizard met eenvoudig te gebruiken gebruikersinterface die het een waardevol hulpmiddel maakt voor computer-geholpen medicijnontwerp. PYRX bevat ook chemische spreadsheet-achtige functionaliteit en krachtige visualisatie-engine die essentieel zijn voor rationeel medicijnontwerp. Wat is er nieuw in deze release: · Toegevoegd opslaan als door komma's gescheiden waarden (CSV)--tool voor databasetabellen. · Toegevoegde plotfunctie voor databasetabellen. Deze functie is toegankelijk via een werkbalkknop onder tabellen tab. Standaard opent het dialoogvenster tafelplotten waarbij een staafstuk van bindende energie versus ligand (index) wordt getoond. Als u PUBCHEM Bioassay hebt geopend met behulp van de open CVS-knop, controleert deze widget ook om te zien of er een uitkomstkolom in die tabel is, en zo ja, zal het kleurenbalken die overeenkomen met "actieve" samengestelde rood en bars die overeenkomen met "inactief" blauw . · Veranderde Standaard Force-veld voor Open Babel Energy Minimalisatie van UFF naar MMFF94. · Veranderde wanbetaling voor maximaal aantal energie-evaluaties (generieke algoritme-parameter in AutoDOCK) van Medium (GA_NUM_EVALS = 2500000) op Short (GA_NUM_EVALS = 250000). · Autodock PBS Job Inzending Progress Dialog toegevoegd. · Een fout opgelost die problemen veroorzaakte bij het weergeven van moleculaire oppervlakken voor aangemeerde conformaties. · Een dialoogvenster toegevoegd om alternatieve conformatie te selecteren bij het maken van macromolecule-bestand (PDBQT) voor AutoDOCK. · Ingeschakeld de kwaliteitsagent van Enthoughts die kan worden gebruikt om bugrapport en opmerkingen van een gebruiker te krijgen. · Toegevoegd optie Annuleren voor Autogrid Web Services. · Implementeerde flexibele resten voor autodock. Deze functie kan toegankelijk zijn door residu (en) onder Navigator-> -moleculen en met de rechtermuisknop te klikken. Selecteer AutoDOCK -> Flexibele residuen om _Flex-map te maken onder Navigator -> AutoDOCK -> Macromoleculen met receptor PDBQT en FLEX.PDBQT. Alle docking naar deze receptor wordt dan gedaan met deze flexibele residu (en). · Bijgewerkt Python naar versie 2.6 en ETS tot 3.4.0.

Pyrx Gerelateerde software