SEQDIVERSE

Een tool die de positionele diversiteit van de volgende generatie sequencing meet
Download nu

SEQDIVERSE Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • MIT License
  • Naam uitgever:
  • Justin T. Brown
  • Uitgever website:
  • http://code.google.com/u/103569611691585664933/
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X
  • Bestandsgrootte:
  • 1.7 MB

SEQDIVERSE Tags


SEQDIVERSE Beschrijving

Een belangrijke stap in de volgende generatie sequencing-analyse-pijplijn is om de kwaliteit van FASTQ-sequenties te bepalen. Sequencing-artefacten zoals (zoals adapterlezing, niet-zo-willekeurige priming, gestreepte sequenties en PCR-vooroordelingen) kunnen invloed hebben op iemands vermogen om de ware aard van de gegevens te onderscheiden. Bovendien moeten vooraf uitlijningsstappen zoals trimmen worden gedaan om de gevoeligheid van de uitlijning te verbeteren. SEQDIVERSE is een gratis en open-source-applicatie die diversiteitsmaatregelen voor sequentiegegevens kan weergeven die deze artefacten kunnen helpen identificeren. Gedetailleerde instructies voor het installeren en gebruiken van het SEQDIVERSE-hulpprogramma op uw MAC zijn hier beschikbaar.Seqdiverse is een cross-platform-hulpprogramma dat kan worden uitgevoerd op elk besturingssysteem dat wordt geleverd met Java-ondersteuning (b.v. Mac OS X, Windows, Linux).


SEQDIVERSE Gerelateerde software