SNP-score

Programma voor de analyse van SNP en de mogelijke effecten op het hebben van twee verschillende nucleotiden kan hebben over de binding van transcriptiefactoren
Download nu

SNP-score Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • SNP score Team
  • Uitgever website:
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X
  • Bestandsgrootte:
  • 54 KB

SNP-score Tags


SNP-score Beschrijving

Programma voor de analyse van SNP en de mogelijke effecten op het hebben van twee verschillende nucleotiden zou kunnen hebben op de binding van transcriptiefactoren SNP-score is voor de analyse van SNP en de mogelijke effecten op het hebben van twee verschillende nucleotiden zouden kunnen hebben op de binding van transcriptiefactoren. SNP-score heeft drie porties erin. Het eerste gedeelte scoort de SNP's die in de invoer worden gegeven, scoor ze tegen een map van positiefrequentiematrices binnen .PFM-bestanden, met een uitvoer van de top 5 transcriptiefactor met de grootste verschillen in scores tussen de twee SNP-allelen voor elke SNP. Het tweede deel is het scoregedeelte van de homologie dat een bestand van homologische sequenties als invoer neemt en vervolgens de transcriptiefactoren scoort tegen de homologe sequenties. Het voert vervolgens de scores en sequenties uit van de hoogste gevonden in een tabel samen met de menselijke SNP-sequenties ter vergelijking. Het laatste gedeelte is een uitlijningsgedeelte dat elke mogelijke sequentie van grootte 40 in de SNP zal nemen en een uitlijning met elke sequentie zal doen van maat 40 in elke homologische sequentie. SNP-partituur uitvoert dan de informatie binnen dezelfde tabel als hierboven. Wat is er nieuw in deze release: · Opties Redone, NU-opties en opdrachtregelopties kunnen samen worden geïnteresseerd. Split-programma om interfaces toe te staan. · Gegenereerde interface voor invoer, scoren en info. · Geïntegreerde get_snp_info met snircore om dingen gemakkelijker en intuïtiever te maken. · Inline invoertype toegevoegd.


SNP-score Gerelateerde software

Slede

Visueel weergeven en analyseren microarray expressiegegevens ...

153 1.8 MB

Downloaden

Erddap

Wetenschappelijke toepassing die voornamelijk naar oceanografische gegevens verwijst ...

154 39 KB

Downloaden

NAFW

Open-source Java Framework voor het ontwikkelen van Attencion-tests ...

322 156 KB

Downloaden