STAPPEN Pakket voor de exacte stochastische simulatie van reactie-diffusiesystemen
Download nu

STAPPEN Rangschikking & Samenvatting

STAPPEN Tags

simuleren model- motor simulatie engine Stochastische simulatie simulatie model

STAPPEN Beschrijving

Pakket voor exacte stochastische simulatie van reactie-diffusiesystemen Stappen is een gratis en open source pakket voor de exacte stochastische simulatie van reactie-diffusiesystemen in willekeurig complexe 3D-geometrieën. Het core-simulatie-algoritme is een implementatie van de SSA van Gillespie, uitgebreid tot omgaan met diffusie van moleculen over de elementen van een 3D-tetraëder mesh. Aanvullende stappen werden voornamelijk ontwikkeld voor het simuleren van gedetailleerde modellen van neuronale signaleringsroutes in dendrieten en rond synapsen, het is ook een generaal Tool en kan worden gebruikt voor het bestuderen van een biochemische route waarin ruimtelijke hellingen en morfologie worden gedacht om een rol te spelen. Vereisten: · Python 2.5 of later

STAPPEN Gerelateerde software