STREEK

Phylogeny-Aware Progressive Sequence Alignment-methode
Download nu

STREEK Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Naam uitgever:
  • ari.loytynoja
  • Uitgever website:
  • http://code.google.com/u/116870160609494076183/
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X 10.7 or later
  • Bestandsgrootte:
  • 310 KB

STREEK Tags


STREEK Beschrijving

Prank is een probabilistisch meervoudig uitlijningsprogramma voor DNA-, codon- en aminozuursequenties. Prank is gebaseerd op een nieuw algoritme dat inserties correct behandelt en overmatige schatting van het aantal verwijderingsgebeurtenissen vermijdt. In aanvulling hierop is PRANK ideeën uit de maximale waarschijnlijkheidsmethoden die worden gebruikt in fylogenetica en houdt rekening met de evolutionaire afstanden tussen sequenties. Ten slotte zorgt ervoor dat PROK een potentiële structuur voor te uiteenlopen te stellen en vervolgens tegelijkertijd met de uitlijning, de locaties van structurele eenheden in de sequenties voorspelt.


STREEK Gerelateerde software