| Seq-gen SEQ-GEN - Toepassing die de evolutie van nucleotide of aminozuursequenties langs een fylogenie zal simuleren |
Download nu |
Seq-gen Rangschikking & Samenvatting
- Naam uitgever:
- Andrew Rambaut
- Uitgever website:
- http://tree.bio.ed.ac.uk/software/seal/
- Besturingssystemen:
- Mac OS X
Seq-gen Tags
Seq-gen Beschrijving
SEQ-GEN - Toepassing die de evolutie van nucleotide of aminozuursequenties langs een fylogenie zal simuleren SEQ-GN is een applicatie die de evolutie van nucleotide of aminozuursequenties langs een fylogenie simuleert, met behulp van gemeenschappelijke modellen van het substitutieproces. Ook zal een reeks modellen van moleculaire evolutie worden geïmplementeerd, inclusief het algemene omkeerbare model.State-frequenties en andere parameters van het model kunnen worden gegeven en de sitepecifieke heterogeniteit van de snelheid kan ook op een aantal manieren worden opgenomen. Elk aantal bomen kan worden gelezen en het programma produceert elk aantal gegevenssets voor elke boom. Aldus kunnen grote sets repliceren simulaties eenvoudig worden gemaakt. Het is ontworpen om een algemene simulator te zijn die de meeste van de algemeen gebruikte (en computationaal tractabele) modellen van moleculaire sequentie-evolutie omvat.
Seq-gen Gerelateerde software