Seriële kloner gratis download, Seriële kloner download op software download

Biedt hulpmiddelen met een intuïtieve interface die u bij DNA-klonen, sequentie-analyse en visualisatie helpt Seriële cloner is een moleculaire biologiesoftware die hulpmiddelen biedt met een intuïtieve interface om u bij DNA-klonering, sequentie-analyse en visualisatie te helpen. Luchtkloner handt nu de kenmerken / annotaties, die de meest gevraagde verbetering is geweest. Gebruiker kan elk sequentiegedeelte annoteren of de automatische scan gebruiken om gemeenschappelijke kenmerken te detecteren.Serial Cloner kan DNA-stuiter-compatibele bestanden lezen en schrijven en bestanden importeren of exporteren in FASTA-indeling. Ook nieuw in deze versie is de mogelijkheid om APE- en VectorNTI-bestanden te lezen met hun functies, evenals PDRAW32-sequenties. Genbank / EMBL-bestanden kunnen ook worden geïmporteerd of gelezen van internet met behulp van de meegeleverde webinterface. Krachtige grafische weergavegereedschappen en eenvoudige interfaces helpen de analyse en constructies op een zeer intuïtieve manier. Alle instrumenten die u nodig hebt om uw sequenties te analyseren en te manipuleren, zijn verkrijgbaar in een alufl-in-one-window-concept. Alle belangrijke functies zijn toegankelijk via een compacte interface.Serial Cloner Hiermee kunt u ook tekstbewerkingskaart bouwen en het snel formatteren om meerdere frame-vertaling toe te voegen of alleen enkele cutters te tonen. De grafische kaart van Serial Cloner is echt grafisch, omdat je eenvoudig een functie kunt selecteren en uitpakken, een fragment of show single, Double of Multiple Cutter in hetzelfde venster.Sial Cloner zal u helpen bij het opzetten van nieuwe subkloningsprojecten en Bij het voorbereiden van de elektronische versies van uw constructies. Naast de klassieke restrictiekaarten - zowel grafische als op tekst-gebaseerde - of sites-gebruiksvensters, kunt u snel een PCR-gebaseerde amplificatie instellen of synthetische adapters voorbereiden. Shrne-constructies op basis van vooraf gedefinieerde steigers zijn ook geautomatiseerd. U kunt fragmenten monteren, verkregen door PCR, Adapter / ShRNA-synthese of eenvoudigweg door grafisch fragmenten te selecteren tussen restrictiesites. Selecteer gewoon, stomp als u nodig hebt en klik op de knop Ligate. Een extra interface maakt eenvoudige gateway-klonering voor zowel BP- als LR-reacties mogelijk. Ten slotte biedt Serial Cloner een interface om twee sequenties uit te lijnen met behulp van een lokaal algoritme of de BLAST2SEQ NCBI-server en een consensus een virtuele snijplotter uit te halen, een webbrowser met instantimport van NCBI / EMBL-vermeldingen en een Silent Restriction Map Generator.Serial Cloner ook Om snel fasta-geformatteerde tekst of bestanden voor te bereiden op een meerlijnverzoek naar clustal. Wat is er nieuw in deze release: · Serial Cloner Handgrepen nu functies / annotaties. Functies kunnen handmatig of door scannen worden toegevoegd (zie hieronder). · Een nieuw paneel in het venster Volgorde om functies / annotaties te beheren · Een scanfunctie (beschikbaar in het venster Volgorde als in de werkbalk) om automatisch functies te detecteren. Op dit moment gebruikt het een interne database. De volgende versie van Serial Cloner zal gebruikerslijsten definiëren. · Automatische scan direct beschikbaar in de grafische kaart (verkrijgbaar bij de werkbalk of in het menu) · Een functie toevoegen na selectie van een segment in de grafische kaart. · Selectie van de functie-sequentie in het venster Volgorde wanneer u dubbelklikt in de functienaam in de grafische kaart. · Monteren en opslaan van een multi-sequentie Fasta-formated-bestand met alle momenteel geopende sequentie (handig voor multi-sequentie-uitlijning (bijvoorbeeld CLUSTAL) INDIENING) · Monteren en kopiëren naar het klembord Een multi-sequence Fasta-formated-tekst met alle momenteel geopende sequentie (bruikbaar voor multi-sequentie-uitlijning (b.v. Clustal) Inzending) · Automatisch herstel van niet-opgeslagen sequenties in (hopelijk zeldzaam) geval van crashen. · Scrollen in reeksen en grafische kaart Windows met muiswiel. · Gebruiker kan de breedte van het grafische kaartvenster wijzigen · De grootte van het geselecteerde fragment wordt nu weergegeven in de grafische kaart · Sleep de restrictie-sites en het functies van de functies in de grafische kaart. · Seriële cloner probeert nu te raden of een gedegenereerd sequentiebestand wordt geopend. · Importeer vector NTI-sequenties met hun functies. · Importeer APE-sequenties met hun functies. · Genbank Sequenties (uit een bestand) importeren met hun functies. · Verschillende snelkoppeling is toegevoegd voor de belangrijkste functies (import, gedegenereerde sequentie, enz.) · Gebruik Alt-Click om alternatieve opdrachten te onthullen die nu beschikbaar zijn in de werkbalk (nieuwe gedegenereerde sequentie, import, interactief gebruik). · Automatische internetproxy-detectie met behulp van systeeminstellingen (lijkt niet te werken als u een .pac-bestand onder MacOSX gebruikt). · MacOSX: een Windows-proxy (kleine zwarte stip die wordt weergegeven in het rode "Sluitenvenster" -bal) wordt weergegeven wanneer de volgorde is gewijzigd en is niet opgeslagen. · Sequence-namen kunnen direct in het reeksvenster worden gewijzigd door te dubbelklikken op de naam of het gebruik van een contextueel menu dat beschikbaar is door CTRL-klikken (of met de rechtermuisknop) op de volgnaam. · Aanvullende parameters kunnen worden ingesteld in het preferente venster (internetproxybeheer, waarschuwing bij het importeren van niet-seriële clonerbestanden). · Uitgebreid contextueel menu in het grafische kaartvenster · CORRECTE SEQUENTIE-indicatie die wordt weergegeven in het venster Volgorde bij het openen van een reeks in een genbank, EMBL, DDBJ, VNTI, PDRAW32 of APE. · import van NCBI-sequenties met behulp van het venster Webtoegang (en de automatische PARSING-knop) is verbeterd · uitlijning bij NCBI met behulp van de Sequence-software van Blast 2 is opnieuw ingesteld. · Verbeter de invoer van de reeks die bijna, maar niet volledig, respecteer de lay-out van NCBI-sequenties (met behulp van de WEB ACCESS Windows). · De interface van het venster wijzigen die wordt gebruikt om de beschikbaarheid van een nieuwe versie aan te kondigen. · afhandeling van bepaalde type IIS-restrictie-enzymen zoals XXXXX, -A, -B of XXXXX, -A, + B. · Een crash die optreedt bij het wijzigen van CW / CCW zonder enige selectie gedaan in grafische kaart. · Een bug in PCR die optreedt bij het versterken van zeer lange sequenties (meer dan 32 k) · MacOSX: een bug in het gedrag van het ladevenster van het venster 'Beheer restrictie enzym'. · Een bug in de fragmentselectie van het venster 'Build A Construct'. · Een zeldzame bug in de lokale uitlijning die een deel van de uitgelijnde uitvoer wist · Een pop-upvensters wordt niet meer weergegeven om aan te geven dat de sequentie is vergrendeld, aangetoond bij het gebruik van de opdracht 'Opslaan als ..'. · De berekening van het% van uitgelijnde nucleotide in het venster Lokaal uitlijning is gecorrigeerd. · Een bug die de seriële kloner voorkomt om fasta-bestanden te importeren die geacentueerde tekens in de koptekst bevatten. · MacOSX: een interface-glitch in de laden 'Vind' van het reeksvenster · Windows: een probleem met 'Pasta-opdrachten' in het venster Find. · Een insect die optreedt bij het terugkijken van DNA van het veld Vertaal als het DNA werd vertaald uit de minstreng. · Een bug die gedegenereerde restrictie-enzymen beïnvloedt in het venster 'Build A Construct'.

Seriële kloner Gerelateerde software