| Sonde Probe - Evalueer atomaire verpakking, hetzij binnen of tussen moleculen |
Download nu |
Sonde Rangschikking & Samenvatting
- Naam uitgever:
- J. Michael Word
- Uitgever website:
- http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php
- Besturingssystemen:
- Mac OS X
Sonde Tags
Sonde Beschrijving
Probe - evalueer de atoomverpakking, hetzij binnen of tussen moleculen Hiermee kan iemand atomaire verpakking evalueren, ofwel binnen of tussen moleculen. Het genereert "Contact Dots" waar atomen in nauw contact zijn. Sonde leest atomaire coördinaten van eiwit-databank (PDB) -findiefindiensten en schrijft dot-lijsten voor opname in een kinemagebestand. Als alternatief kan de verpakkingsinformatie worden gekwantificeerd en weergegeven in een tabelvermeldingscores voor Van der Waals-interacties, H-obligaties en atomaire overlappingen ("Clashes"). Bovendien kan Sonde ook eenvoudig contactoppervlakken genereren binnen een reeks atomen ("zelfstippen") en zelfs "oppervlaktespunten" waar geen nabijgelegen atomen zijn.
Sonde Gerelateerde software