Stroom Een raamwerk om transcriptionele regelgeving te modelleren met behulp van statische thermodynamische modellen
Download nu

Stroom Rangschikking & Samenvatting

Stroom Tags

Bewerk model- transcriptional-verordening modelgen voorspellen transcriptie gen

Stroom Beschrijving

Een raamwerk om transcriptionele verordening te modelleren met behulp van statische thermodynamische modellen De naam van de Stream Java-applicatie is een afkorting van de volgende lange naam: Statisch thermodynamisch regelgevingsmodel van transcriptie. Stream is in het kort een bio-informatica-aanvraag voor onderzoekers, die de transcriptionele regeling van een specifiek gen wil modelleren en de transcriptionele uitgang in verschillende situaties voorspellen. Registratie is het eerste openbare beschikbare kader voor het modelleren, visualiseren en voorspellen van de verordening van de transcriptie Snelheid van een doel-gen.beschermde transcriptionele regulering van een gen in detail is een cruciale stap in de richting van blootstelling en uiteindelijk gebruik van de regelgevende grammatica van het genoom. Modellering van transcriptionele verordening met behulp van thermodynamische vergelijkingen is een steeds belangrijkere aanpak geworden voor dit doel. Geven de concentratie van een reeks transcriptiefactoren, evenals de bindende sites voor transcriptiefactor in een reguliere DNA-regio en de concentratie van het doel-gen, zal de stroom optimaliseren Parameters om een model te genereren dat het beste bij de invoergegevens past. Dit getrainde model kan vervolgens worden gebruikt om: · te valideren dat de gegeven set van TFS het doel-gen en · de transcriptierate onder verschillende omstandigheden voorspelt (b.v. verschillende weefsels, knock-out / extra TFS of gemuteerde / vermiste TFB's). Vereisten: · Java

Stroom Gerelateerde software