Tracer

TRACER - Gratis app voor het analyseren van de traceerbestanden die zijn gegenereerd door Bayesian MCMC-runs
Download nu

Tracer Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • Andrew Rambaut
  • Uitgever website:
  • http://tree.bio.ed.ac.uk/software/seal/
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X
  • Bestandsgrootte:
  • 3.5 MB

Tracer Tags


Tracer Beschrijving

Tracer - Gratis app voor het analyseren van de traceerbestanden die zijn gegenereerd door Bayesian MCMC-runs Tracer is een gratis app voor het analyseren van de traceerbestanden die zijn gegenereerd door Bayesian McMC-runs (dat wil zeggen, de continue parameterwaarden die uit de keten worden bemonstigd). Het kan worden gebruikt voor het analyseren van runs van Mrbayes, Lamarc, beest en mogelijk andere MCMC-programma's. Er zijn 4 analysetabbladen om uit te kiezen: · Schattingen - dit toont de gemiddelde, STDEV-, betrouwbaarheidsintervallen en andere statistieken over de geselecteerde parameter. Een frequentieverdeling wordt ook uitgezet. · Dichtheid - Dit toont het Bayesiaanse posterieure dichtheidsplot voor de geselecteerde parameter. · Gezamenlijk-marginaal - dit verschijnt alleen als exact 2 parameters worden gekozen (houd de shift ingedrukt om meerdere parameters te selecteren). Vervolgens plotsert het tegen de ander om naar hun gezamenlijke marginale distributie te kijken. · Traceer - Dit toont het spoor van de parameter tegen de staat of het generatienummer. Gebruik dit om het mixen te controleren, kies een geschikte burn-in en zoek naar trends die problemen met convergentie kunnen voorstellen. REQUIRINGEN: · Java 1.5 of hoger


Tracer Gerelateerde software