 | jmotu |
| Download nu | |
jmotu Rangschikking & Samenvatting
Advertentie
- Vergunning:
- Freeware
- Naam uitgever:
- Mark Blaxter
- Uitgever website:
- http://www.nematodes.org/
- Besturingssystemen:
- Mac OS X
- Bestandsgrootte:
- 7.5 MB
jmotu Tags
jmotu Beschrijving
Software voor clusteringstreepjescode DNA-sequentiegegevens in moleculaire operationele taxonomische eenheden (MOTU) Jmotu is een gratis en eenvoudig te gebruiken softwarepakket voor clusteringstreepjescode-DNA-sequentiegegevens in moleculaire operationele taxonomische eenheden (MOTU). Jmotu kan grote gegevenssets verwerken en gebruikt een reeks filterstappen om het aantal exacte wereldwijde uitlijningen te minimaliseren dat moet worden uitgevoerd. Bij het berekenen van de paarsgewijze afstanden, negeert JMOTU lacunes en telt alleen nucleotide mis-matches, waardoor het relatief robuust is voor sequentiebepaling die worden veroorzaakt door homopolymeerruns. Clustering wordt uitgevoerd met behulp van een hebberig algoritme dat niet afhankelijk is van de volgorde van invoersequentie. JMOTU is getest op onbewerkte datasets van ongeveer 50.000 invoersequenties en kan grotere datasets clusteren door het voorkomen van subsets van gegevens voordat ze worden gecombineerd voor een wereldwijde analyse.
jmotu Gerelateerde software
