Codoncode aligner Een geweldige aanvraag voor sequentiesamenstelling, contkende bewerkings- en mutatiedetectie
Download nu

Codoncode aligner Rangschikking & Samenvatting

Codoncode aligner Tags

analyseren analys detecteren analyseer sequentie detecteren mutatie bewerk contig

Codoncode aligner Beschrijving

Een geweldige aanvraag voor sequentiesamenstelling, contkende bewerkings- en mutatiedetectie Codoncode-aligner is een programma voor sequentie-assemblage, contkenbewerking en mutatiedetectie, beschikbaar voor Windows en Mac OS X. Afstemming is compatibel met Phred-Phrap en ondersteunt de scores van sequentiekwaliteit volledig, terwijl u een vertrouwde, gemakkelijk te leren gebruikersinterface aanbiedt .Codoncode-aligner Hiermee kunt u ten volle profiteren van moderne algoritmen voor basisbel- en sequentiesamenstelling, zonder u te dwingen om gecompliceerde opdrachtregelopties of PERL-programmering te leren. Hier zijn enkele belangrijke kenmerken van "Codoncode-aligner": · Importeer sequenties van tekstbestanden. · Importeer sequenties van ABI- en SCF-bestanden. · Eindclip. · Vector trim. · Monteer contigingen. · Lijn uit op een referentiesequentie. · Lijn de contigningen aan elkaar uit terwijl u de links naar de sporen houdt. · Monteren of uitlijnen in groepen, op basis van monsternamen. · Zoek heterozygote mutaties. · Analyseer heterozygote inserties en verwijderingen. · Definieer regio's van interesse ("functies"), bijvoorbeeld consensusregio's voor lage kwaliteit. · Navigeer snel tussen door de gebruiker gedefinieerde functies. · Importeer en bewerk de Pklap-gegenereerde assemblages. · Voer Phred en Phrap rechtstreeks uit van uitlijnprojecten. · U hebt ook de mogelijkheid om functies en sequenties te exporteren. · Exporteer gemonteerde assemblageprojecten. Beperkingen: · 30 dagen proefperiode. · U kunt in uw projecten alleen ongeassembleerde monsters gebruiken. · Ook kunt u niet opslaan, exporteren of afdrukken van projecten die Contigs bevatten, of nadat u een van de beperkte functies hebt geprobeerd (aligner u eerst waarschuwt). Wat is er nieuw in deze release: · Aminozuurvertaling voor alle monsters. · Gebaseerde achtergrond van eiwitvertaling. · Verschiltafels. · Import rechtstreeks uit Genbank. · Scriptmenu. · Nieuwe scriptopdrachten. · Importeer 454 gegevens (SFF-bestanden). · Maak nieuwe tekstsequenties. · Ondersteuning van grotere projecten. · Snellere assemblages. · Automatisch geheugengebruik op Windows. · Verbeterde ondersteuning voor pentablet.

Codoncode aligner Gerelateerde software