CrystalExplorer

CrystalExplorer - Volledig weergegeven moleculair Crystal Visualization-tool
Download nu

CrystalExplorer Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • University of Western Australia
  • Uitgever website:
  • http://www.hirshfeldsurface.net/CrystalExplorer/
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X 10.5 or later
  • Bestandsgrootte:
  • 9.6 MB

CrystalExplorer Tags


CrystalExplorer Beschrijving

CrystalExplorer - Volledig aanwezig Moleculair Crystal Visualization Tool Crystalexplorer is een volledig uitgeruste moleculaire kristalvisualisatie-tool, beschikbaar voor Mac OS X, Windows en Linux. Crystalexplorer zal een nieuwe manier bieden om moleculaire kristallen te visualiseren met behulp van de volledige suite van Hirshfeld Surface Tools.Note: gratis voor academisch, niet-commercieel gebruik. Main-functies van Crystalexplorer: Hirshfeld Surfacethe Hirshfeld-oppervlak is een unieke definiton van een molecuul in een kristal. Het oppervlak wordt gedefinieerd door het gedeelte van de ruimte waarin de promolecule-elektronendichtheid meer dan de helft van de totale procurestal-elektronendichtheid draagt. Crystalexplorer genereert en geeft Hirshfeld-oppervlakken weer op de manier waarop ze waren bedoeld en stelt u in staat om eigenschappen op het Hirshfeld-oppervlak toe te passen, waaronder de , dnorm, vormindex en gebogenheid. Elke kleurregeling op het Hirshfeld-oppervlak benadrukt verschillende aspecten van de kristallen verpakking die moeilijk te ontdekken was door traditionele middelen. VeelPrintPrintDe vingerafdrukplot van het Hirshfeld-oppervlak is een tweedimensionaal, full-color Vertegenwoordiging van alle intermoleculaire interacties in een kristalstructuur. Het vingerafdrukplot is een werkelijk unieke manier om de aard van de intermoleculaire interacties in een kristal snel te begrijpen, en wordt gemakkelijk gereproduceerd op het scherm of papier. Gecomponeerde oppervlakken en vingerafdrukken is het vermogen om het oppervlak en de vingerafdrukplot te ontbinden om zich te concentreren op bijzonder Soorten intermoleculaire interacties, zoals gerapporteerd in onze recente chemische communicatie.See welke delen van het molecuul betrokken zijn bij een bepaald type intermoleculaire interactie door alleen die contacten op het oppervlak te benadrukken. Vergelijk interoleculaire interacties tussen structuren door de vingerafdruk voor alleen dat type interactie te onderzoeken. Performeert kwantitatieve vergelijkingen tussen structuren op basis van de bijdrage aan het oppervlak van een bepaalde interactie. In 3-aminofenol (rechts), de afgebroken vingerafdruk toont duidelijk de bijdrage aan de Structuur van n ··· H, O ··· H, C ··· H en H ··· H intermoleculaire contacten. Deze afgebroken versie van de vingerafdruk is handig voor het vergelijken van slechts een enkel type interactie tussen gerelateerde structuren. POV-RAY ExportProduce glanzende, likbare graphics voor een tijdschriftomslag, of voor uw poster, door afbeeldingen uit Crystalexplorer te exporteren als een POV-Ray-invoerbestand . Download en installeer POV-ray op uw computer om grafische resolutie te genereren met één klik in Crystalexplorer.tontothe, open-source-programma Tonto drijft de berekeningen van Crystalexplorer. Hierdoor heeft u toegang tot een volledig uitgerust quantum-mechanisch programma met de mogelijkheid om eigenschappen zoals elektrostatische potentialen en AB-initio-moleculaire elektronendichtheden te berekenen. U kunt zelfs een van deze eigenschappen in kaart brengen op het Hirshfeld-oppervlak! Wat is er nieuw in deze release: Gaussian Support: deze versie voegt ondersteuning toe voor het berekenen van moleculaire golfbescheiden met Gaussian 98/03 bij het installeren. Opmerking: Helaas waren we niet in staat om deze functie te laten werken op Windows. Voorkeuren Window: We zijn klaar met het verplaatsen van alle instellingen en voorkeuren in een paneel voor één voorkeuren, beschikbaar in het menu Bestand (of het CrystalExplorer-menu op Mac OS X). Waar mogelijk worden wijzigingen onmiddellijk van kracht, dus er is geen OK of toepasbare knop. Menu's herschikken: we hebben de menu's gereorganiseerd om ze consistenter te maken en we hebben enkele menu-items verwijderd die niet werkten (zoals het menu-item Set Lading). Opgeslagen weergaven: u kunt nu de oriëntatie en schaal van uw weergave opslaan (weergave! Sla deze weergave op), ga later later terug naar die weergave (Weergave! Krijg opgeslagen weergave). Dit is met name handig wanneer u afbeeldingen bespaart en het is belangrijk dat ze op dezelfde schaal zijn. U kunt één weergave per kristal besparen. Verbeteringen aan vingerafdrukplotten: vingerafdrukpercelen worden nu automatisch gegenereerd wanneer het oppervlak wordt gegenereerd en het vingerafdrukvenster wordt automatisch bijgewerkt om de juiste plot weer te geven wanneer u met de rechtermuisknop op een oppervlak klikt. Fingerafrint-export is nu EPS, in plaats van gewoon postscript, voor eenvoudiger incorporatie in documenten. Nieuwe licentiesysteem: dit moet transparant zijn voor u (omdat u al een licentie hebt), maar we hebben het generatiesysteem van de licentie volledig herschreven, om een terugkerende bug te voorkomen waar mensen met bepaalde lettercombinaties in hun naam ongeldige licenties kregen. Dit probleem werd in de loop van de tijd meer gebruikelijk (omdat er een datumcomponent in de licentiecode was). Betere afhandeling van aandoening: terwijl aandoening nog steeds een serieus probleem is voor analyse met behulp van Hirshfeld-oppervlakken (zie hier), doen we tenminste nu een betere taak van het tekenen van gestoorde structuren op het scherm. Atomen in verschillende wanorde-groepen worden niet langer getekend als gebonden; Wanneer een structuur (of een deel van een structuur) meer dan twee of meer sites is geworden, drukt u op CTRL-D om verschillende weergave van de ongeordende atomen te schakelen volgens de instelling in het deelvenster Contact en Disorder Preferenties. Veel, veel bugfixes.


CrystalExplorer Gerelateerde software

jood

JUDE - een leuk klein programma dat hoogwaardige Julia Set Fractals genereert. ...

170 110 KB

Downloaden

SimplePrint

SUPPERPRINT Suite - Drie toepassingen om netwerk een beetje gemakkelijker afdrukken te maken voor de Mac Enterprise-community ...

143 140.4 MB

Downloaden

Tolk

Batch-omzetter voor beeld-, muziek- en archiefbestanden ...

153 9.1 MB

Downloaden