Arabidopsis motiefscanner Ontarmen van gen relaties en functies.
Download nu

Arabidopsis motiefscanner Rangschikking & Samenvatting

Arabidopsis motiefscanner Tags

Arabidopsis motiefscanner Beschrijving

Arabidopsis Motif Scanner (AMS) is een Windows-toepassing die op lokale computers werkt. Het is ontwikkeld om gen-netwerken te bouwen door de posities van CIS-regulerende elementen te identificeren in het modelplant Arabidopsis Thaliana en door een eenvoudige interface te bieden om gen-relaties te beoordelen en te evalueren. Het belangrijkste innovatieve functie is om de CIS-reguleringselementposities, NGS- en DNA-chiparrays expressiegegevens, Arabidopsis-annotaties en gen-interacties voor de identificatie van gen-netwerken die door transcriptiefactoren worden gereguleerd. In studies gericht op de functie voor transcriptiefactoren, gebruikt de software de expressiegegevens en bindende site-motieven in de regelgevende gen-regio's om directe doelgenen te voorspellen. Bovendien maakt AMS gebruik van DNA-eiwit- en eiwitproteïne-interactiegegevens om de identificatie van de metabole routes te vergemakkelijken die worden gereguleerd door de interesse van de transcriptiefactor.

Arabidopsis motiefscanner Gerelateerde software