BEEST Analyseer moleculaire sequenties met deze software.
Download nu

BEEST Rangschikking & Samenvatting

BEEST Tags

analys analyse Analyseren moleculair moleculaire afbeeldingen visualiseer moleculaire structuren Moleculaire machine Moleculaire interactienetwerken moleculair ontwerp Molecular Simulation Zoek moleculaire onderbouw Moleculaire simulator Analyseer biologische sequenties moleculair oppervlak Analyseer moleculaire sequenties Moleculaire sequentiesanalysator Bayesiaanse MCMC-analyse Analyseer moleculaire markeringsgegevens neutraal moleculair analyseren polypeptidesequenties Moleculaire fylogenetica analyseren molecuulgewicht metagenomische sequenties analyseren RNA-sequenties analyseren analyseer RNA-sequenties

BEEST Beschrijving

Bayesiaanse evolutionaire analyse sampling bomen of, simpelweg, beest, is een applicatie ontworpen voor het analyseren van moleculaire sequenties. Een meer wetenschappelijke beschrijving voor het doel ervan zou zijn dat het de middelen verschaft om fylogenieën te reconstrueren en ook werkt als platform voor evolutionaire hypothese-tests met geen conditionering op een enkele boomtopologie. Het is gebaseerd op Java, een afhankelijkheid die niet automatisch wordt gedownload tijdens de installatieprocedure van het programma. Als Java niet aanwezig is op het systeem, wordt het product niet gestart.Functionaliteit en bruikbaarheidWanneer u begint, beest vereist een aantal initiële instellingen, waaronder het verstrekken van een voorbeeldbestand, het definiëren van het aantal kettingen en het kiezen tussen delta- of temperatuurparameters. Het parseren van het kan vrij lang duren, vooral als een onderkijksel wordt gebruikt. Tijdens de operatie worden de systeembronnen niet gespaard omdat ze onder opvallende stress worden geplaatst, zowel CPU-stroom als RAM-gebruik. Vanwege het door de toepassing geaccepteerde XML-formaat is er geen poging om het type analyse-onderzoekers te bepalen die willen uitvoeren, maar biedt de mogelijkheid om het te selecteren. Volgens de documentatie is er een nadeel van deze aanpak aangezien constructiemodellen mogelijk niet goed presteren onder het conferentiekader van Monte Carlo (MCMC) van Markov Monte Carlo (MCMC). Ook op het nadeel moeten gegevens zorgvuldig worden geïnspecteerd omdat na het parseren van het beest niet met een eenvoudig antwoord bedenkt. Als zodanig is in sommige gevallen wat sleutelen nodig om ervoor te zorgen dat de informatie correct is verwerkt. CONCLUSIEBEAST is ontworpen als een wetenschappelijk hulpmiddel en het pakt de gemiddelde gebruiker niet aan. Werken met het is niet moeilijk, maar interpreteert de resultaten en zorg ervoor dat de gegevens correct zijn verwerkt, vereisen solide achtergrond in moleculaire sequentie-analyse. Beoordeeld door Ionut Ilacu, laatst bijgewerkt op 22 maart 2014

BEEST Gerelateerde software