BN-BS Schat filiaallengten in termen van synonieme en niet-synonieme substituties
Download nu

BN-BS Rangschikking & Samenvatting

BN-BS Tags

Schatting schatting Tak Office Consolidation tak vestigingsstrategie ActiveX-tak vergelijking tarief van niet-sympathiek synoniem afstand niet-synonieme afstand Radicale nonsynonische afstand Synonieme substitutie Nonsynonische substitutie Schatting van de tak lengte Taklengte Code taknaam Codetak bibliotheek tak Tak Toegang synoniem

BN-BS Beschrijving

De BN-BS-aanvraag is ontwikkeld voor het schatten van taklengten in termen van synonieme en niet-sympathieke substituties per site, terwijl de Tree Topology wordt gegeven. Het programma gebruikt de gemodificeerde NEI-GOJOBORI-methode om de koppige synonieme en niet-synieme afstanden onder hedenssequenties te schatten en vervolgens de taklengtes en hun varianties te schatten door de gewone MINST-SQUARES-methode te gebruiken. Om het programma te gebruiken, hebt u een invoerbestand nodig dat de eiwitcoderings-DNA-sequenties bevat (zie Infile voor een voorbeeld). Dit bestand begint met twee cijfers: het aantal sequenties en het aantal nucleotiden per sequentie (volglengte). De tweede regel is de naam van de eerste reeks en de derde regel is de eerste reeks, enzovoort. Alleen a, g, c, t, a, g, c en t zijn toegestaan in sequenties. Hiaten moeten worden verwijderd en sequenties moeten van tevoren worden uitgelijnd. De laatste regel van het bestand is de boomtopologie van de sequenties. Het boomformaat is hetzelfde als die wordt gebruikt in Phylip-pakket (Felsenstein 1995). Merk op dat de boom niet-ontgroeid is, dus de trap in plaats van bediening is vereist voor het diepste vertakkingsknooppunt

BN-BS Gerelateerde software