Bissnp BISULFITE-SEQ / NOME-SEQ SNPS EN CYTOSINE Methylateller Beller
Download nu

Bissnp Rangschikking & Samenvatting

Bissnp Tags

Snurk

Bissnp Beschrijving

Bissnp is speciaal ontwikkeld als een handige tool die is gebaseerd op de Toolkit van Genomanalyse. BISSNP maakt gebruik van de Bayesiaanse gevolgtrekking met handmatig gespecificeerde of automatisch geschatte methyleringskansingen van verschillende cytosine-context voor het tegelijkertijd van genotypes en methyleringsniveaus. De software kan werken voor Single-End en Paired-End leest. Bissnp is ontwikkeld in de taal van Java-programmeert. Belangrijkste kenmerken: Oproep en vat methylering van elke meegeleverde cytosine-context samen (CPG, CHH, CHG, GCH et.Al); Nauwkeurige variante detectie. Schakel de herecalibratie van de basiskwaliteit in en die in bisulfietsequenties bellen; Sta meervoudig uitvoerformaat, gedetailleerde VCF-bestanden toe, CPG HAPLOTYPE leest het bestand voor mono-allelische methyleringsanalyse; Vereenvoudigde Bedlaph, pruik en bed-formaat voor visualisatie in de Browser en de IGV-browser van UCSC.

Bissnp Gerelateerde software