Blastalign Lijn de nucleotidesequenties uit
Download nu

Blastalign Rangschikking & Samenvatting

Blastalign Tags

Lijn de tekst uit Uitlijnen align sequentie volgorde filmsequenties videofragmenten Object uitlijnen Uitlijnen op canvas nucleotidevenredance object align Tekst uitlijnen Lijn de foto uit nucleotidesequentie nucleotidesequentiemanager nucleotide match sequenties Lijn de controle uit Inhoud uitlijnen align parallelle data gedragssequenties matrixweergave aligh-sequentie aligh Peptide uitlijnen Nucleotide-substitutiemodel nucleotide motief Substitutie van nucleotide Nucleotide-annotatie Nucleotide-uitlijning Lijn de eiwitsequenties uit Eiwit uitlijnen analyseren polypeptidesequenties Polypeptidesequenties nucleotide polymorfismen metagenomische sequenties analyseren Nucleotide-mutatie nucleotide fractie opeenvolgingen

Blastalign Beschrijving

De Blastalign-applicatie gebruikt NCBI-explosie om nucleotidesequenties uit te lijnen die grote indelen (inserties / verwijderingen) hebben of anders moeilijk zijn om wereldwijd in overeenstemming te komen. Het programma selecteert de meest representatieve sequentie van de invoersequenties en haalt vervolgens de BLAST-query verankerd meerdere uitlijning (in Nexus- en Phylip-indelingen). Als alternatief kan de gebruiker kiezen welke volgorde als anker te gebruiken is. Het programma geeft ook een matrix uit die gebieden van homologie langs de sequenties vertegenwoordigt, die kunnen worden gebruikt om subgroepen te identificeren die bepaalde grote indelen delen. Een extra programma, BlastalignP gebruikt TBLASTN om nucleotidesequenties uit te lijnen naar een enkele aminozuurreferentie-sequentie, waardoor een open leesframe kan worden gehandhaafd in de meerdere uitlijning.

Blastalign Gerelateerde software