CGView Circulaire genoomvisualisatie en exploratie
Download nu

CGView Rangschikking & Samenvatting

CGView Tags

kijker ontdekkingsreiziger Genoomverkenner

CGView Beschrijving

CGView is een Java-pakket voor het genereren van hoogwaardige, zoignabele kaarten van cirkelvormige genomen. Het primaire doel is om te dienen als een component van annotatietuigleidingen van sequentie, als een middel om visuele uitgang te genereren die geschikt is voor het web. Functie-informatie- en renderopties worden aan het programma geleverd met behulp van een XML-bestand, een tabbladgebak of een NCBI PTT-bestand. CGView converteert de ingang in een grafische kaart (PNG, JPG of schaalbare vector grafische indeling), compleet met labels, een titel, legendes en voetnoten. Naast de standaard volledige weergavekaart, kan het programma een reeks hyperlinked kaarten genereren met uitgebreide weergaven. De gekoppelde kaarten kunnen worden verkend met behulp van een webbrowser, waardoor het surfen van een snelle genoom mogelijk is en het delen van gegevens vergemakkelijken. De feature-labels in kaarten kunnen worden gehyperlinkt naar externe bronnen, waardoor CGView-kaarten kunnen worden geïntegreerd met bestaande websitegehalte of -databases. Krijg CGView en probeer het eens te proberen de capaciteiten ervan volledig te beoordelen! Belangrijkste kenmerken: -afbeeldingen kunnen worden gegenereerd in PNG, JPG of SVG-indeling. Statische of interactieve kaarten kunnen worden gegenereerd. De interactieve kaarten maken gebruik van standaard PNG-afbeeldingen en HTML-afbeeldingskaarten. Schaalbare vector grafische uitgang is opgenomen in de interactieve kaarten. De XML-ingang maakt volledige controle mogelijk over het uiterlijk van de kaart. Tab-gescheiden ingangsbestanden en NCBI PTT-bestanden kunnen worden gebruikt als een alternatief voor het XML-formaat. De CGView API kan worden gebruikt om CGView in Java-toepassingen op te nemen. De CGView-applet kan worden gebruikt om zoignable kaarten op te nemen in webpagina's. De CGView-server kan worden gebruikt om online kaarten te genereren.

CGView Gerelateerde software