Cbcanalyzer Fylogenies afleiden op basis van compenserende basisveranderingen (CBCS)
Download nu

Cbcanalyzer Rangschikking & Samenvatting

Cbcanalyzer Tags

simuleer de fylogenies Phylogenies-simulatie schat grote fylogenies grote fylogenies-schatting Grote fylogenies-analyse compenserende basenverandering CT Transform CBC Detect Cttransform Cbcdetect CBC Boom

Cbcanalyzer Beschrijving

De CBCANALYzer (CBC = compenserende basiswissel) is ontwikkeld om een aangepaste geschreven software-toolbox te zijn bestaande uit drie delen, CTtransform, CBCDetect en CBCTREE. CTtransform leest verschillende CT-bestandsindelingen (CT-bestandsindelingen (CT, RNAVIZ CT of MAC CT), en genereert een zogenaamde `` `bracket-dot-bracket '-indeling die typisch wordt gebruikt als input voor andere hulpmiddelen zoals Rnaforester, Rnamovie of Marna. Deze laatste creëert een meerdere uitlijning op basis van primaire sequenties en secundaire structuren die nu kunnen worden gebruikt als invoer voor CBCDetect. Hierbij tellen we voor CBC's in alle tegen alle uitgelijnde sequenties, wat belangrijk is bij het detecteren van soorten, gediscrimineerd op hun seksuele incompatibiliteit. De matrix van het aantal (afstand) verkregen door CBCDetect wordt gebruikt als invoer voor CBctree die een fylogram reconstrueert met behulp van het algoritme van BIONJ.Note: CBCanalyzer is vrij beschikbaar voor niet-commercieel gebruik

Cbcanalyzer Gerelateerde software