Clans

Een klein tool geschreven in Java voor clusteranalyse van sequenties.
Download nu

Clans Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • CLANS Team
  • Bestandsgrootte:
  • 976 KB

Clans Tags


Clans Beschrijving

Vaak wordt homologie gebruikt als een reden om kennis over functie of structuur over te brengen van bekende tot onbekende eiwitten. Hoewel fylogenies de methode van keuze zijn bij een poging om de homologie te bepalen, is de meest gebruikte marker een paarse sequentie-overeenkomst. Het probleem van het vinden van groepen co-gereglementeerde genen in een aantal microarray-experimenten is behoorlijk vergelijkbaar met het probleem van het vinden van groepen homologe eiwitten in een grote dataset. In beide gevallen hebben we enorme hoeveelheden gegevens en zijn op zoek naar die paar genen die een soort van significante overeenkomst vertonen. Moederlijke CO-Regulering en vermeende homologie worden in het algemeen afgeleid uit overeenkomsten in de functieset van een gen. In het eerste geval bestaat de functies die uit de expressieniveaus in de experimenten bestaat, in het tweede geval van de aminozuursequenties van de eiwitten. Een zekere gelijkenis is ook duidelijk wanneer u kijkt naar de grafieken die worden gegenereerd voor eiwitsequentiegegevens of microarray-gegevens. Krijg clans en neem het voor een spin om te zien wat het voor u kan doen!


Clans Gerelateerde software